ЭлБиб

принимают во внимание или в расчет число вариантов внутри проана-

лизированных генетических единиц и те, которые основываются на от-

носительной частоте вариантов.

1.6

.1.1. Показатели полиморфизма, принимающие во внимание

(в расчет) число вариантов

Число вариантов очень чувствительно к размеру, т.е. к количест-

венной величине образца ГРР [

159]

, и не может быть использовано в тех

случаях, где эта величина варьирует значительно, даже если использо-

ванные статистические подходы корректируют показатели полимор-

физма (индексы, коэффициенты) до постоянной величины [

183, 120].

Проблемы становятся более острыми, если использованные при этом

маркеры характеризуются проявлением одного, но часто встречающего-

ся варианта или многочисленными, но редкими вариантами (случай

изоферментов). Более того, число (маркерных?) вариантов может быть

неинформативным, особенно, если оно граничит с верхним пределом (2

в случае

RAPD

или

AFLP).

1.6

.1.2. Показатели полиморфизма, принимающие во внимание

(в расчет) частоты вариантов

Наиболее часто используемый индекс полиморфизма получен на

основе показателя, выведенного при проведении исследований в эколо-

гии [

341]

. Он был перенесен в популяционную генетику [

243]

и введен в

употребление под названием показатель

генного разнообразия

(

) [272,

274]

. Генное (оно же генетическое в узком смысле этого слова) разно-

образие определяют как вероятность того, что два варианта, отобранные

внутри генетической единицы случайным образом, будут отличаться

друг от друга. Этот показатель очень популярен в популяционной гене-

тике, особенно при работе с ГРР, поскольку он эквивалентен уровням

гетерозиготности в популяции при панмиктическом равновесии и пото-

му его значение существенно зависит от количества наиболее часто

встречающихся аллелей, и тем самым ограничивает число образцов, не-

обходимых для его установления или оценки.

Были предложены и другие показатели: например, эффективное

число аллелей [

88]

, информационная функция

Shannon-Weaver [220]

Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека