29 / 202
27
1.7. Оценка уровня разнообразия
с помощью различных типов маркеров
1.7.1.
На уровне аллелей
Наиболее общее математическое выражение генетического разно-
образия
h
дикорастущих и возделываемых видов растений дано в 1973
году [272]. Если объектами изучения являются гаплотипы или аллели
данного локуса с
А
количеством вариантов, то уравнение можно запи-
сать так:
,
(9)
или так
:
,
где
p
i
(или
p
j
) частота аллеля
i
(или
j
).
В этом уравнении предполагается, что аллели расположены в
произвольном порядке. Если же они могут быть упорядочены на основе
какой
-
либо «внешней», например, фенологической информации, а их
взаиморасположение выражено как функция дистанции ∆
ij
между алле-
лями
i
и
j
, то уравнение разнообразия примет вид:
(10)
Важно заметить, что это с количественной точки зрения больше
не является вероятностью, по которой два аллеля выбранные случайным
образом из популяции, будут отличаться, но есть средняя дистанция
(или, как ее еще называют, генетическое расстояние) между аллелями,
присутствующими в популяции.
Для большинства маркеров практически невозможно получить
информацию, которая смогла бы облегчить упорядочение аллелей. В
этом случае ∆
ij
равно 1 для всех пар рассматриваемых аллелей и урав-
нение
(10)
становится эквивалентным уравнению
(9)
. С другой стороны,
для маркеров, основанных на использовании последовательностей тан-
демных повторов (например, микросателлитов, рДНК), преобразование
одного аллеля в другой часто происходит посредством добавления или
удаления единицы повтора. Следовательно, число единиц повторов,
разделяющих два подобного рода маркера, может влиять на точность
Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека