21 / 202
19
Таблица
1
Сравнение нуклеотидного полиморфизма гена,
кодирующего большую субъединицу рибулозо
-1,5-
дифосфаткарбоксилазы
(
rbcL
) у различных видов растений (по [
48])
Виды
Длина по-
следова
-
тельности
Число
замен
K
1
K
2
K
3
Zea mays
(О)
1422
232
0,163
0,184
0,186
Triticum aestivum
(О)
1425
227
0,159
0,179
0,181
Serenoa repens
(М)
985
122
0,124
0,135
0,137
Magnolia macrophylla
(М)
1425
165
0,116
0,126
0,128
Spinacia oleracea
(О)
1425
214
0,150
0,168
0,171
Quercus rubra
(М)
1425
173
0,121
0,132
0,134
Itea virginica
(М)
1407
166
0,118
0,128
0,129
Petunia hybrida
(О)
1425
209
0,147
0,163
0,166
О — однолетнее растение; М — многолетнее растение;
K
1
— число замен на нук-
леотидную последовательность (
K
=
n
d
/
n
, см. текст);
K
2
— число замен на сайт с
коррекцией по [
191];
K
3
— число замен на сайт с коррекцией по [
199
]. Коррекции,
которые принимают в расчет рекуррентные замены в одном и том же нуклеотидном
сайте, подтверждаются фактом, что значения
K
1 относительно высоки (см. текст).
Следует заметить, что оба метода коррекции дают очень схожие результаты. Нук-
леотидный полиморфизм варьирует в соответствии с однолетним или многолетним
периодом вегетации изученных видов. Как следует из приведенных данных, моле-
кулярная эволюция гена, кодирующего
rbcL
, происходила намного быстрее у одно-
летних растений, чем у многолетних.
1.5.2.
Установление нуклеотидной дивергенции
методами маркерных технологий
Методы маркерных технологий, разработанные на основе исполь-
зования рестриктных ферментов или ПЦР амплификаций, объединяет
тот факт, что они выявляют полиморфизм сайта узнавания последова-
тельности в зависимости от используемого подхода. Это — сайт рест-
рикции в случае
RFLP
, сайт гибридизации праймеров для
RAPD
или два
сайта в случае
AFLP
. Посредством набора сайтов узнавания, молеку-
лярные маркеры позволяют измерять или устанавливать нуклеотидное
разнообразие по шкале генома. Метод установления базируется на
предположении, что любое изменение последовательности, например,
замена, в сайте узнавания (или между двумя сайтами узнавания) выра-
жается в присутствии или отсутствии полосы на электрофоретическом
профиле. Средняя пропорция полос общих для двух последовательно-
Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека