28 / 202
Таблица
3
Корреляционный коэффициент разнообразия
,
оцененного с помощью двух различных типов маркеров
на одних и тех же популяциях
Виды
N
P
N
1 тип
маркера
n
1
2 тип
маркера
n
2
Коэффициент
корреляции
Вероятность
Литературный
источник
Zea mays
10
30
изоферменты
20
RFLP 35
0,466
0,125
[113]
Brassica campestris
20
?
изоферменты
5
RFLP 4
0,544
0,025
[253]
Hordeum vulgare
19
?
изоферменты
7
RFLP 18
0,562
0,050
[421]
Brassica oleraceae
5 20-100
изоферменты
4
SSR 7
0,900
0,089
[311]
Beta vulgaris
6
5
RFLP
4
SSR 1
0,928
0,044
[97]
Picea mariana
12 11-30
изоферменты
14
RAPD 22
0,400
0,464
[185]
Brassica oleraceae
18 38-60
изоферменты
4
RAPD 64
–
0,100
0,764
[213]
Hordeum vulgare
12
20
изоферменты
6
RAPD 77
0,685
0,024
[283]
Pinus pinaster
23
30
SSR
3
AFLP 122
–
0,271
0,341
[240]
Quercus petraea
7 50-200
SSR
6
AFLP 155
–
0,649
0,103
[241]
Quercus robur
7 50-200
SSR
6
AFLP 155
0,180
0,691
[242]
N
P
— число популяций;
N
— средний размер образца популяций;
n
1
и
n
2
— число изученных локусов для маркеров 1 и 2. Для до-
минантных маркеров (
AFLP, RAPD
) данные были проанализированы либо методом
G
1, либо
G2. G
1 соответствует вычислению
разнообразия, установленного посредством вычисления аллельных частот;
G2
— тот же анализ, но исключающий локусы для кото-
рых частота гомозигот для нуль
-
аллелей меньше чем 3/
N
(рекомендации [
232]).
F
— индекс фиксации используемый для межал-
лельных частот для доминантных маркеров. Показатели генетического разнообразия очень слабо коррелируют, когда их устанавли-
вают с помощью различных маркерных подходов: всего лишь в 4 из 36 случаев изучения были найдены достоверные корреляции
(ошибка I типа: 0,05, т.е. статистическая значимость корреляций находится на уровне 0,05 или 5%). Низкие коэффициенты корреля-
ций, скорее всего, являются результатом плохого подбора проб или образцов, т.е. проб или образцов
,
не отвечающих необходимым
критериям проводимого анализа, особенно по числу локусов. Другие случаи могут относиться к низкой дифференциации между
популяциями по степени их биологического разнообразия [
241].
26
Электронная Научная СельскоХозяйствен
м
н
ле
ч
н
в
е
ия
у
ая
о
Б
(
I
т
с
иб
к
о
с
лиотека