8 / 58
7
2016 |
№2
ТЕОРИЯ И ПРАКТИКА ПЕРЕРАБОТКИМЯСА
Стоит отметить, что мажорные белки сердечных
мышц
Bos taurus
и
Sus scrofa
, оказались практически
одинаковыми. Однако существенные межвидовые от-
личия были обнаружены при сравнении протеомных
профилей образцов аорты. Особенно ярко они прояв-
лялись на примере тканеспецифичных белков (
рис. 2,
табл. 1
): в ткани аорты
Sus scrofa
были обнаружены
аполипопротеин А-1 (13, 14), участвующий в образо-
вании липопротеинов высокой плотности, перокси-
редоксин-1 (10, в смеси с трансгелином), участвующий
в подавлении окислительного стресса, галектин-1 (17),
индуцирующий апоптоз Т-лимфоцитов, а также ряд
белков теплового шока, имеющих молекулярную мас-
су менее 30 кДа.
Влияние автолиза на сохранность целевых ткане-
специфичных белков, обнаруженных в тканях аорты
Sus scrofa
, было также изучено методом двумерного
электрофореза по О’Фарреллу (
Рис. 3
).
В результате исследований было показано, что
обнаруженные тканеспецифичные белки (аполипо-
протеин А–1, пероксиредоксин 1, галектин-1 и белки
Major proteins of
Bos taurus
and
Sus scrofa
cardiac mus-
cle were almost identical. However, significant interspecies
differences were found when comparing the proteomic
profile of the aorta samples. Tissue-specific proteins were
identified in
Sus scrofa
aorta tissue (Figure 2, Table 1): apo-
lipoprotein A-1 (13, 14) involved in the formation of high-
density lipoproteins, peroxiredoxin-1 (10, in mixture with
transgelin) involved in the suppression of oxidative stress,
galectin-1 (17) induced apoptosis of T-lymphocytes, as well
as a number of heat shock proteins with molecular weight
less than 30 kDa.
Autolysis effect on target tissue-specific proteins
detected in
Sus scrofa
aorta tissues was also studied by
two-dimensional electrophoresis according to O’Farrell
(Figure 3
).
It was shown that the detected tissue-specific pro-
teins (apolipoprotein A-1, peroxiredoxin 1, galectin-1 and
Table 1. The results of mass spectrometric identification (MALDI-TOF/MS and MS/MS) of protein fractions in
Sus scrofa
aorta tissue
Табл. 1. Результаты масс-спектрометрической идентификации (MALDI-TOF MS и MS / MS) белковых фракций из ткани аорты
Sus scrofa
No. |
№ Protein name; (
Gene symbol)
| Наименование белка; (
символ гена
)
S / M/ C
*
mM/pI
(experiment)** |
Мм/pI (эксп.)**
mM/pI
(calculation)** |
Мм/pI (расчет.)**
1 Fragment of type II cytoskeletal keratin 1 (
KRT1
) |
Фрагмент цитоскелетного 1 кератина II типа (
KRT1
)
74/9/17
55.0/8.10
65.9/8.16
2
Actin-related protein 3 (
ACTR3
) |
Актин-связанный белок 3, actin-related protein 3 (
ACTR3
)
174/15/43
47.0/5.60
47.4/5.61
3 Fragment of type II cytoskeletal keratin 1 (
KRT1
) |
Фрагмент цитоскелетного 1 кератина II типа, (
KRT1
)
59/7/15
48.0/5.55
65.9/8.16
4 X1 isoform of integrin-linked kinase (
ILK
) |
Интегрин-связанная протеинкиназа изоформа Х1, (
ILK
)
188/21/45
50.0/8.00
51.4/8.30
5
X2 isoform of β-enolase (
ENO3
) | β-енолаза изоформа Х2, (
ENO3
)
259/25/64
47.0/8.05
47.1/8.05
6
X1 isoform of prolargin (
PRELP
) | Проларгин изоформа Х1, (
PRELP
)
73/2/5
63.0/7.95
43.7/9.53
7
X1 isoform of poly-(ADP-ribose)-polymerase 6 (
PKM
) |
Поли (АДФ-рибозо)-полимераза 6 изоформа Х1, (
PKM
)
161/17/38
58.0/8.10
57.8/7.96
8 Protein 1 containing 4 ½ LIM domain, isoform C, isoform X5 (
FHL1C
) |
Белок 1 содержащий 4 ½ LIMдомена, изоформыС изоформа Х5, (
FHL1C
)
79/7/24
29.0/9.00
33.5/8.75
9 Transgelin (
TAGLN
) | Трансгелин, (
TAGLN
)
327/32/86
22.0/8.40
22.6/8.87
10 Mixture transgelin (
TAGLN
) and X5 isoform of peroxiredoxin 1 (
PRDX1
) |
Смесь трансгелина, (
TAGLN
), и пероксиредоксина 1 изоформа Х5, (
PRDX1
)
283/31/82
106/11/52
22.0/8.20
22.6/8.87
21.9/8.67
11 Albumin (1) (
ALB
) | Альбумин (1), (
ALB
)
168/8/16
250.0/6.80
69.3/5.92
13
Pre-apolipoprotein A-1
(
APOA1
) |
Пре-аполипропротеин А-1,
(
APOA1
)
177/19/51
25.0/5.00
30.0/5.47
14
Apolipoprotein A-1
(
APOA1
) |
Аполипропротеин А-1
(
APOA1
)
152/15/46
25.0/4.95
30.3/5.38
15
Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B
(
LOC100154783
) |
Пептидил-пролил цис-транс изомераза B
(
LOC100154783
)
220/11/33
18.0/9.20
23.9/9.44
16 Calponin-1 (
CNN1
) | Кальпонин-1 (
CNN1
)
212/21/49
28.0/8.95
33.2/8.91
17
Galectin-1
(GLN1)
|
Галектин-1
(GLN1)
178/8/50
14.5/4.85
14.6/5.07
18
S100-A13 protein
(
S100A13
)**** |
Белок S100-A13
(
S100A13
)****
77/1/17
11.0/5.00
11.0/5.46
* S/M/C — traditional identification indicators adopted in the English literature: Score — indicator of conformity or «scorecard»; Match
peptides — the number of matched peptides; Coverage —% coverage of the entire amino acid sequence of the protein by identified peptides.
** mM/pI (experiment) — scores obtained as a result of electrophoretic mobility on the DE and mM/pI (calculation) — estimates made based
on amino acid sequence data with consideration of signal peptide removal, but with no consideration of other post-synthetic modifications
using the ExPASy Compute pI/Mw tool software.
* S/M/C — традиционные показатели идентификации, принятые в англоязычной литературе: Score — показатель соответствия или
«счет очков»; Match peptides — количество совпавших пептидов; Coverage —% покрытия полной аминокислотной последовательно-
сти белка выявленными пептидами.
** Мм/pI (эксп.) — полученные оценки по результатам электрофоретической подвижности на ДЭ, а Мм/pI (расчет.) — расчетные
оценки, сделанные из данных об аминокислотной последовательности с учетом удаления сигнального пептида, но без учета других
постсинтетических модификаций с использованием программы ExPASy Compute pI/Mw tool.
Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека