ЭлБиб

158

вание эффектов QTL, если используют множественные родственные

семейства. Программа MAPPOP была предложена для селективного

картирования и картирования при выбранном интервале значений слу-

чайной величины (bin mapping), посредством выбора хороших образцов

из картирующих популяций, и для локализации новых маркеров на

предсуществующих картах

[393]

. В дополнение была разработана про-

грамма QTLNetwork, для картирования и визуализации генетической

архитектуры, подчеркивающей сложные признаки, в эксперименталь-

ных популяциях, полученных в результате скрещивания двух инбред-

ных линий

;

[410]).

Как только базирующиеся на Интернет–технологиях программ-

ные средства стали все более и более востребованы, использующее Ин-

тернет–технологии QTL аналитическое программное обеспечение стало

доступным. В качестве примера можно привести программу WEBQTL,

созданная как интерактивная Интернет страница, полезная для изучения

и анализа генетической модуляции тысяч фенотипов

собранных за бо-

лее чем 30

летний период сотнями исследователями, используя рефе-

ренсные панели рекомбинантных инбредных штаммов мышей

WEBQTL включает плотные,

проверенные на ошибки генетические карты, так же как и наборы дан-

ных экстенсивной экспрессии генов (фирмы Affymetrix), полученные в

результате анализов более чем 35 штаммов мышей. Использующий ин-

тернет

технологии удобный для пользователя пакет QTL EXPRESS

[333]

), предназначенный для картирования QTL в

беспородных популяциях, был разработан для скрещенных линий, се-

мейств полусибс, а также ядерных семейств и сибсовых пар. Этот пакет

предлагает две опции для тестов значимости QTL: тесты пермутации

для определения эмпирических уровней значимости и метод ступенча-

того перехода от малых значений к большим или наоборот

(bootstrapping) для установления эмпирических доверительных интерва-

лов локализации QTL. Фиксированные эффекты/ковариаты (независи-

мые переменные) могут быть подогнаны, а модели могут включать оди-

ночные или множественные QTL.

Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека