ЭлБиб

153

все молекулярные карты, основанные на первом поколении молекуляр-

ных маркеров

(RFLP),

были построены с помощью этого программного

продукта. Альтернативой является MAP MANAGER CLASSIC — гра-

фическая, интерактивная программа для картирования менделевских

локусов. Она проводит все необходимые расчеты и построения на осно-

ве информации, полученной при межвидовых скрещиваниях с кодоми-

нантными маркерами, беккроссных (backcross, ВС) или рекомбинант-

ных инбредных линий (

RIL

) у экспериментальных растений или живот-

ных (

[237];

http://www.mapmanager.org/mapmgr.html)

Иногда для построения карт могут быть нужны некоторые специ-

альные статистические модификации, при этом используют маркеры со

строгим расхождением с сегрегацией в популяциях. MAPDISTO

(http://mapdisto.free.fr/

)

— программа для картирования генетических

маркеров в случае сегрегационного расхождения при использовании та-

ких расщепляющихся экспериментальных популяций как ВС, удвоен-

ные гаплоиды (double haploid, DH) и

RIL

. Она может: (1) рассчитывать и

рисовать генетические карты посредством графического интерфейса и

(2) облегчать анализ маркерных данных, экспонируя сегрегационные

расхождения благодаря различиям в жизнеспособности гамет или зигот.

Карты или данные от множественных популяций, полученных в

результате различных скрещиваний, могут быть объединены в одну или

консенсусную карту посредством совместного картирования (joint

mapping). JOINMAP представляет собой программное обеспечение для

построения карт генетического сцепления для нескольких типов карти-

рующих популяций: BC

, F

, RIL

, и

, регенерированные из

поколений, а также семейств полных сибсов, полученных в результате

скрещиваний неблизкородственных родителей (

http://www.kyazma.nl/

index

.php/mc.JoinMap/). Она может объединять (соединять — join) дан-

ные, полученные из нескольких источников в интегрированную карту и

реализовывать некоторые другие функции, включая определение групп

сцепления, автоматическое определение фазы для семейств полных

сибсов, полученных в результате скрещиваний неблизкородственных

родителей, некоторые построения диагностических графиков и карт

[390].

Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека