ЭлБиб

157

настоящим SAS программным шаблоном, который пользователи долж-

ны настроить для того, чтобы она подходила к их данным. В простей-

ших случаях пользователи могут изменить только названия файлов, со-

держащих их данные. Однако алгоритмы программы основаны на мето-

де наименьших квадратов и нет возможности проводить интервальное

картирование

[174].

Байесовскому картированию QTL в последние годы было уделено

много внимания и, благодаря этому, на его основе были разработаны

специальные компьютерные программы. Например, программное обес-

печение BQTL (байесовское картирование локусов количественных

признаков — Bayesian Quantitative Trait Locus mapping) было разработа-

но для картирования генетических признаков в популяциях, получен-

ных от скрещивания линий и в RIL (

http://hacuna.ucsd.edu/bqtl;

[45]).

Оно выполняет: (1) установление максимального правдоподобия в

мультигенных моделях; (2) байесовское оценивание мультигенных мо-

делей посредством аппроксимаций Лапласа; и (3) интервальное и ком-

позитное интервальное картирование генетических локусов. Программа

BLADE (байесовское картирование неравновесного сцепления —

Bayesian LinkAge DisEquilibrium mapping) была создана для байесовско-

го анализа гаплотипов с целью неравновесного

LD (linkage

disequlibrium

) картирования

(http://www.people.fas.harvard.edu/~junliu/

TechRept/03.html; [225, 227]). MULTIMAPPER

— программное обеспе-

чение для байесовского картирования QTL при анализе ВС,

и дан-

ных поколения

, полученного в результате скрещивания инбредных

линий

[248]

. Программа MULTIMAPPER/OUTBRED дополнила этот

список популяциями, полученными от беспородных линий

(http://www.rni.helsinki.fi/~mjs/)

Несколько пакетов ПО по картированию было разработано для

картирования QTL, необходимых в особых специфичных случаях. Про-

грамма MCQTL разработана для одновременного картирования QTL во

множественных скрещиваниях и популяциях (

http://www.genoplante.com

;

[190]

). Она позволяет анализировать обычные популяции, полученные в

результате скрещивания инбредных линий, и может соединять (связы-

вать) семейства при допущении, что месторасположение QTLу всех у

них одно и то же. Более того, возможно также диаллельное моделиро-

Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека