ЭлБиб

155

включая двуродительские сегрегирующие популяции, а также наборы

(серии, ряды) двуродительских или двуаллельных популяций. Наиболее

часто используемым программным обеспечением в 1980

-1990-

х годах

было MAPMAKER/QTL, являющее сестринской программой

MAPMAKER/EXP, разработанной

[212]

(http://www-genome.wi.mit.edu/

genome_software).

Это ПО основывается на установлении максимально-

го правдоподобия сцепления между маркером и фенотипом, используя

для этого интервальное картирование, которое имеет дело с несложным

QTL и несколькими стандартными популяциями. Другое раннее про-

граммное обеспечение

MAPL (MAPping and QTL analysis;

http://lbm.ab.a.u-tokyo.ac.jp/software.html

; [385]

) позволяет пользовате-

лям получать результаты по уровню расщепления, тесту сцепления,

значению рекомбинации, группировать маркеры, располагать маркеры в

определенном порядке посредством метрического многомерного мас-

штабирования, рисовать карту и графически изображать генотип и кар-

ту

QTL

посредством интервального картирования и дисперсионного

анализа (analysis of variance, ANOVA).

Широко используемым для картирования

QTL

является про-

граммное обеспечение QTL Cartographer

(http://statgen.ncsu.edu/qtlcart/

cartographer.html), которое обеспечивает выполнение нескольких стати-

стических методов, используя множество маркеров одновременно,

включая сложное интервальное картирование (

CIM

) и множественное

композитное интервальное картирование (англ.

multiple composite

interval mapping, MCIM

). Взаимодействие между идентифицированны-

ми

QTL

также может быть установлено. PLABQTL использует состав-

ное интервальное картирование со многими функциями схожими с QTL

Cartographer. QTL

может быть локализовано и охарактеризовано в по-

пуляциях, полученных самоопылением потомков двуродительского

скрещивания, или получением линий удвоенных гаплоидов (

). Про-

стое и составное интервальное картирование производят, используя мо-

дель множественной регрессии. В качестве дополнительной функции ко

многим другим пакетам ПО, может быть использован анализ взаимо-

действия

QTL-

окружающая среда

[386].

Программа QGENE

(http://www.qgene.org/)

предназначена для

проведения сравнительного анализа наборов данных по картированию

Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека