ЭлБиб

151

Глава

VI.

ПРОГРАММНОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ

ДЛЯ ГЕНЕТИЧЕСКОГО КАРТИРОВАНИЯ

И АНАЛИЗА АССОЦИАЦИЙ МАРКЕР/ПРИЗНАК

Для того чтобы получить необходимую информацию о месторас-

положении

QTL

в геноме проводят их молекулярно

генетическое кар-

тирование, в результате которого определяют не только их локализа-

цию, но и то, от какого родителя получен тот или иной аллель

QTL,

процент фенотипической изменчивости, определяемый каждым из вы-

явленных

QTL

, и, конечно же, молекулярный маркер или маркеры с ко-

торыми сцеплены идентифицированный локус или локусы на группах

сцепления. Одним из важнейших требований для картирования

QTL

яв-

ляется возможность производить обмеры и статистический анализ вари-

анс исследуемых признаков для установления достоверных корреляций

между QTL и тем или иным маркером. Подробности применения таких

подходов были описаны нами ранее

[8, 13].

Еще одним из необходимых требований, на основе которого стро-

ятся современные генетические карты — это наличие ассоциаций мар-

кер

признак и неравновесного сцепления (LD) между ними

[14, 15, 367].

LD связано с исторически или эволюционно неравным и разнородным

уровнем рекомбинации специфичных аллелей в различных локусах, оп-

ределяющих проявление изучаемой генетической изменчивости в попу-

ляции. Неравновесное сцепление может быть установлено статистиче-

ски и его выявление уже широко используется для картирования и даже

клонирования генов, определяющих сложные признаки у человека, жи-

вотных и растений

[14, 16, 18]

. С изменением направления вектора уси-

лий по идентификации и локализации генов/локусов хромосом от дву-

родительского скрещивания к естественным популяциям линий или об-

разцов коллекций ГРР, и от традиционного

QTL

картирования к

ас-

социативному анализу, исследователи получили новый мощный инст-

румент по картированию интересующих их генов. Ассоциативное или

картирование позволяет не только проводить анализ, классифициро-

вать и группировать естественные и селекционные популяции (дикие

виды, примитивные формы, сорта, линии), но и более эффективно ис-

Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека