В
иноделие
и
иноградарство
6/2012
8
!
ПРОБЛЕМЫ ОТРАСЛИ
Информационное обеспечение
российской генетической
коллекции винограда
В. С. Петров
, д-р с.‑х. наук;
М. А. Сундырева
, канд. с.‑х. наук;
О. М. Ильяшенко
, канд. с.‑х. наук;
В. А. Большаков
Северо-Кавказский зональный научно-исследовательский институт садоводства и виноградарства
настоящее время значитель‑
ный объем накопленной в
мире информации о культуре
винограда представлен в диапазо‑
не от генетических до хозяйствен
но-ценных признаков и свойств
различных генотипов. В научном
виноградарстве созданы обширные
банки данных генетических, ампе‑
лографических и производственных
признаков винограда, при этом ми‑
ровая коллекция насчитывает более
8000 сортов винограда, описание
которых в той или иной степени
представлено в существующих ин‑
формационных источниках. Научно
обоснованная информация имеет
первостепенное значение для дли‑
тельного и трудоемкого селекцион‑
ного процесса и совершенствования
сортимента. В настоящих условиях
возрастает потребность в наиболее
полном и мобильном использова‑
нии информации для совершен‑
ствования методов селекции, созда‑
ния современного высокоадаптив‑
ного, устойчивого и экологического
виноградарства. Для решения акту‑
альных задач все большее значение
приобретает возможность обработ‑
ки больших объемов информации в
кратчайшие сроки, что может быть
достигнуто за счет систематизации
данных и автоматизации их обра‑
ботки, т. е. создания компьютерных
баз данных.
Европейская база данных Vitis
(The European Vitis Database)
соз‑
дана в 2007 г. при Институте Julius
K
ü
hn (JKI) — Федеральный науч‑
ный центр культурных растений,
Институте разведения виноградной
лозы Geilweilerhof, Siebeldingen в
Германии. Ее создание с бесплат‑
ным доступом через Интернет
проведено в рамках европейского
проекта
Genres081
. Последующая
деятельность и ее расширение будут
осуществляться в рамках проектов
GrapeGen06
и Европейской со‑
вместной программы генетических
ресурсов сельскохозяйственных
культур (
ECPGR
).
The European Vitis
Database
содержит каталог SSR-
маркеров, который пополняется
учеными, работающими в указанных
проектах на добровольной основе.
Информация, содержащаяся в этой
базе данных, является точной и ак‑
туальной на момент ее выдачи. JKI
не может контролировать исполь‑
зование ресурсов базы данных и не
несет ответственности в отношении
использования этой информации
получателями и содержания внеш‑
них интернет-страниц или страниц,
на которых дается ссылка на
The
European Vitis Database
[1].
Swiss Vitis Microsatellite Data
base
(SVMD, швейцарская база дан‑
ных микросателлитных маркеров
винограда) является стандартизи‑
рованной базой данных микросател‑
литных последовательностей прак‑
тически всех виноградных сортов,
подвоев или диких форм виногра‑
да, произрастающих в Швейцарии.
Она содержит результаты геноти‑
пирования 170 сортов винограда
по 6 микросателлитным маркерам
В
(VVMD5, VVMD7, VVMD27, VVS2,
VrZAG62 и VrZAG79), выбранным в
качестве основных международным
сообществом генетики винограда. В
SVMD запросы могут быть сформу‑
лированы по названию сортов или
синонимам, названию, размеру, по‑
следовательности или аллелям [2].
Институт винограда и вина «Ма‑
гарач» (Крым, Украина) и Кубан‑
ский государственный аграрный
университет (Краснодар, Россия)
при научно-техническом сотрудни‑
честве с Критским университетом
(Греция) выполняли проект
«Соз-
дание мультимедийной web-backed
генетической базы данных Украин-
ской, Молдавской и Российской за-
родышевой плазмы Vitis vinifera»
, в
рамках которого изучали генетиче‑
ские ресурсы
Vitis vinifera
, а также
представление их в виде генетиче‑
ской базы данных на европейском
уровне через Интернет. Сорта,
включенные в базу данных, являют‑
ся наиболее древними автохтонны‑
ми сортами.
Основные компоненты
базы данных — информационная
,
включающая сведения о сортах
(название, синонимы, родословные,
краткая характеристика сорта и
др.);
ампелографическая
(база дан
ных молодого побега, взрослых
листьев и гроздей);
база данных
ядерных микросателлитных про-
филей
(база данных генетической
идентичности) [3].
Greek Vitis database — греческая
база данных Vitis L.
, по сути, вклю‑
чает
6 баз данных
:
информационную
базу данных (содержит всю воз‑
можную информацию о греческих
сортах винограда); базу данных
микросателлитных профилей грече-
ских сортов
; базу данных
микроса-
теллитных профилей хлоропластов
греческих сортов
;
комбинированную
базу данных из двух предыдущих
баз;
описательную
базу данных ам‑
пелографических характеристик
270 сортов [4].
В
Italien Vitis Data Base
пред‑
ставлены микросателлитные про‑
фили ядерной ДНК и ампелогра‑
фические характеристики виногра‑
да. Эта база данных пополняется
генетическими характеристиками
различных сортов винограда, по‑
лученными в результате проекта
GrapeGen06
. Внесенная информация
автоматически систематизируется
специальным ПО. Также база дан‑
ных содержит ампелометрические
УДК 634.84
Ключевые слова:
виноград, генофонд, описание, база данных
Key words:
grapes, gene pool, description, database
Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека