Академик РАСХН Рогов И.А., Кроха Н.Г., Валихов А.Ф.,
НародицкиЙ Б.С., Цветков И .Л ., Комаров А.Б.
СПЕЦИФИЧЕСКОЕ ВЫЯВЛЕНИЕ ДНК ИЗ ГЕНЕТИЧЕСКИ
МОДИФИЦИРОВАННЫХ РАСТЕНИЙ В ПИЩЕВЫХ ПРОДУКТАХ
МЕТОДОМ ПОЛИМЕРАЗНОЙ ЦЕПНОЙ РЕАКЦИИ
Московский Государственный университет прикладной биотехнологии
ООО "Компания Биоком"
Риск употребления в пшцу продуктов переработки ГМИ человеком не имеет пока
реальных обоснований, однако, доказательств абсолютной безопасности трансгенов для
здоровья человека и его потомства тоже не достаточно. В связи с этим представляются
совершенно необходимыми методы высоко чувствительной и строго специфической
идентификации трансгенных растений и продуктов их промышленной переработки.
Одним из таких методов, наиболее перспективным для широкого внедрения в практику
является полимеразная цепная реакция (ПЦР), оптимизированная для детекции
трансгенной ДНК, присутствие которой в растительном сырье свидетельствовало бы о
генно-инженерном происхождении его источника или содержании в нем
соответствующих примесей.
В соответствии с рекомендациями ИЮПАК и по аналогии с Allin
1.0
мы
разработали свой протокол и соответствующий ему набор реагентов для детекции 35S
промотора в трансгенной ДНК. В ходе разработки мы апробировали чувствительность и
специфичность нашего протокола на пищевых продуктах, а также постарались оценить,
насколько пищевые продукты, произведенные из ГМИ, распространены на рынке Москвы
и Московской области.
Все оборудование и наборы реагентов, использованные нами в работе, если это
особо не оговорено, произведены ООО«Компания Биоком» (Москва).
Выделение ДНК из пищевых продуктов, полуфабрикатов и живого растительного
материала (свекла) производили с использованием набора реагентов ПУН путем
специфической сорбции на суспендированных частицах Nucleo S в соответствии с
прилагаемой к набору инструкцией. Качество полученных препаратов ДНК и ее
приблизительную концентрацию определяли визуально после электрофореза с ТАЕ
буфером в слое 0.8%-ного агарозного геля (окрашивание бромистым этидием,
визуализация в ультрафиолетовом свете). При необходимости получения более точных
данных о концентрации ДНК в полученных препаратах (определение порога
чувствительности ПЦР) пользовались спектрофотометрическим методом. ПЦР проводили
с использованием набора Gene Pack Universal, представляющего собой готовые к
употреблению пробирки, которые содержат ингибированную для «горячего старта» Taq
полимеразу (1 ед.), 200 мкМ каждого из дезоксирибонуклеозидтрифосфатов, 2,5 мМ
хлорида магния и оптимизированную буферную смесь. В эти пробирки добавляли по 5
мкл препарата ДНК и по 10 пкмоль праймеров, подобранных нами для специфическкой
амплификации фрагмента 35S промотора длиной 160 п.н.: праймер 1 (прямой) 5-CCG
АСА GTG GTC CCA AAG ATG AGG
-У,
праймер 2 (обратный) 5'-АТА TAG AGG AAG
GGT СТТ GCG GAC G-3'; синтезированы праймеры ЗАО «Синтол» (Москва). Программа
амплификации оптимизирована для Amply 4L и состоит из предварительной денатурации
при 94°С в течение 4 мин, 35 циклов, включающих два шага 94°С 45 сек и 72°С 1 мин 10
сек, и «досинтеза» при 72°С в течение 5 мин.
8
Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека