19 / 202
17
(коэффициентами) диссимилярности [
230]
и мультивариантными стати-
стическими методами, которые позволяют описать общую организацию
разнообразия. Такой подход используют, если доступны маркеры, полу-
ченные в результате проведения генетического фингерпринтинга. При-
рода маркеров имеет значение только при качественном сравнении раз-
личных исследований: если не установлено, что локусы должны опре-
делять характерные черты (придавать индивидуальный характер), то
границы применимости используемых маркеров определяются случаем
исследования. Во второй группе, данные анализируют в
генетических
терминах, используя при этом кодоминантные (например,
RFLP, STS,
SSR, SNP
) или доминантные маркеры (
RAPD, AFLP
), а выявленные ло-
кусы рассматривают
индивидуально
. В целом, молекулярно
-
генетический анализ богаче фенотипического и лучше подходит для по-
строения логических умозаключений по эволюции и структуре популя-
ций, в том числе и селекционных. Исходя из анализа нуклеотидного по-
лиморфизма, разнообразие, отмечаемое на молекулярном уровне, может
быть выражено количественно, в частности, посредством вычисления
среднего числа замен на нуклеотидный сайт. Это число может быть ус-
тановлено исходя либо из анализа первичной структуры нуклеотидной
последовательности, либо из данных, полученных с помощью молеку-
лярных маркеров.
1.5.1.
Установление молекулярной дивергенции на основе
первичной структуры нуклеотидной последовательности
Рассмотрим два аллеля известной нуклеотидной последовательно-
сти, которые проявляют различия по сайтам 5 и 14:
cайт
5
14
аллель 1 ACCT
G
CTATCTTA
C
GACGGTCGCGATGATA
аллель 2 ACCT
C
CTATCTTA
G
GACGGTCGCGATGATA
Предположим, что оба аллеля эволюционировали отдельно друг
от друга за период времени
Т
(
Т
также может быть число поколений).
Каждая последовательность подвергалась мутациям, которые явились
результатом замены одних нуклеотидов другими. Пусть
K
будет сред-
нее число замен на нуклеотидный сайт, продуцируемых последователь-
Электронная Научная СельскоХозяйственная Библ отека