91 / 202
89
3.3.4.
Отклонение от нормальности
Метод интервального картирования, основанный на
LOD score,
применяемый для признаков с непрерывной изменчивостью, дает нор-
мальное распределение математических остатков. Для признаков, изме-
ряемых по шкале (часто градуированной от 0 до 5), например, устойчи-
вости к болезням и/или признаков с высоко ассиметричным распреде-
лением, при использовании данного метода существует риск получить
отклоняющиеся от нормы результаты. В таком случае можно применять
непараметрические тесты, которые не требуют выдвижения предполо-
жения о распределении данных
[208]
или специфичные методы для при-
знаков в классах
[160]
. Тем не менее, несмотря на высказанные опасе-
ния, показано
[313]
, что если изучаемая популяция достаточно велика,
то тест интервального картирования, основанный на регрессии, на-
столько же эффективен, как и непараметрические тесты, и поэтому он
достоверен в случае большого диапазона распределений.
3.4.
Достоинства и недостатки популяций,
наиболее часто используемых для определения
QTL
3.4.1.
Сравнение популяций
F
2
, беккроссов, удвоенных гаплоидов
и рекомбинантных инбредных линий
При использовании популяций беккроссных, удвоенных гаплои-
дов или рекомбинантных инбредных линий, в отличие от популяций
F
2
,
как правило, сравнивают только значения двух средних по данному
маркеру. Такие расчеты могут быть сделаны посредством критерия
Стьюдента (
t
-
тест) или более сложным методом. Но не все эффекты
QTL
возможно оценить с помощью этих популяций. Для удвоенных га-
плоидов и рекомбинантных инбредных линий, может быть установлена
а
, но не доминирование. Для беккроссов, где гомозиготный генотип
сравнивается с гетерозиготным, выявленный эффект (
m
12
–
m
11
) или
(
m
12
–
m
22
), будет равен ±
а
или (±
а
´) только в рамках предположения об
отсутствии доминирования. В противном случае, найденное значение,
поскольку оно равно ± (
a
+
d
) или ± (
a
–
d
), будет зависеть от двух па-
раметров, причем без какой
-
либо возможности оценить их отдельно
друг от друга (за исключением варианта, где используют реципрокные
Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека