ЭлБиб

3.3.1.

Определение силы и изменчивости внутри классов

В статистике ошибка

типа (α) есть вероятность наблюдения эф-

фекта фактора, когда его нет, т.е. наблюдать эффект случайным обра-

зом. Применительно к определению

QTL

, это соответствует вероятно-

сти определения «фальшивого»

QTL

. Ошибка

типа (β) соответствует

вероятности не наблюдать эффект фактора, когда этот эффект есть. В

случае определения

QTL

данный вариант соответствует вероятности то-

го, что тест не выявит

QTL

, когда этот локус есть. Сила теста, 1 – β, есть

вероятность принятия верного решения. В нашем случае — это опреде-

ление реального

QTL

. Таким образом, при проведении исследований по

идентификации

QTL

необходимо находить компромиссное решение для

ограничения числа фальшивых позитивов без особо сильного уменьше-

ния силы теста. Вдобавок к этому, выбор α и β всегда будет зависеть от

целей эксперимента. Так, например, если требуется провести предвари-

тельное установление «вероятных» позиций

QTL

может быть допущена

высокая ошибка

типа α (около 0,05 или 0,1), а если планируется прове-

дение клонирования

QTL

, то тогда должно быть взято значительно бо-

лее низкое значение α. Для данного количества образцов сила определе-

ния

QTL

зависит, с одной стороны, от аддитивного эффекта

QTL

(очень

маленькие различия эффектов между аллелями не могут быть найдены

достоверно) и, с другой стороны, от изменчивости внутри генотипиче-

ских классов или внутриклассовая вариабельность. Это изменение зави-

сит от нескольких факторов:



Во

первых, от эффектов воздействия окружающей среды (контроль

изменений, возникающих под воздействием окружающей среды, уве-

личивает силу теста).



Во

вторых, от других сегрегирующих

QTL

в геноме. Действительно,

особи генотипического класса данного

QTL

не фиксированы по дру-

гим распределенным по остатку генома

QTL

и, таким образом, могут

представлять различные фенотипические значения (проявления при-

знака), в соответствии с их генотипом в других

QTL

. Эпистатические

эффекты могут лишь ухудшать или отягчать этот феномен. Для того

чтобы улучшить силу детекции локусов

QTL

с мягким эффектом про-

явления, находящихся в генетическом окружении, где есть

QTL

сильным эффектом, может быть использована двустадийная модель

Электронная Научная СельскоХ зяйственная Библиотека