ЭлБиб

пликаций на генотип. Одна репликация на большом числе генотипов

позволяет достичь максимума силы. Дополнительные данные по изуче-

нию силы теста, как функции размера и типа изучаемых популяций, бы-

ли опубликованы ранее

[201].

3.3.3.

Выбор статистических рисков

Во многих экспериментальных исследованиях ошибка

типа, вы-

бранная для анализа варианс по индивидуальным маркерам, равна α

0,05 или α = 0,01. Поскольку, как правило, проводится большое число

анализов, такие высокие значения ошибки

типа неизбежно приводят к

выявлению фальшивых

QTL

(100 независимых тестов с α = 0,05 проду-

цируют в среднем пять фальшивых позитивов). Даже если маркеры не

независимы, должны выбираться низкие уровни α. Выбор должен опи-

раться на число маркеров, при этом необходимо помнить, что подобно-

го рода выбор увеличивает ошибку

типа (т.е. уменьшает силу теста).

Схожим образом, при интервальном картировании,

всеобщая

ошибка

типа (при α = 0,05 для целого генома) придает довольно высокое значе-

ние

LOD

на интервал, размер которого, в свою очередь, зависит от

плотности маркеров и генетической длины генома. Так, например, для

генома в 1000 сМ с маркерами через каждые 15 сМ была предложена

пороговая величина

LOD

равная 2,4

[211]

. Вслед за этим появился ме-

тод

[314]

, с помощью которого можно было производить аналитическое

вычисление приближенной пороговой величины

LOD

для каждой груп-

пы сцепления. Пороговая величина вычислялась как функция длины и

маркерной плотности данной группы сцепления. Одновременно были

предложены тесты преобразования

[81]

, основанные на случайном пе-

ревыборе (

resampling

) данных для оценки эмпирической и устойчивой

пороговой величины. И, наконец, необходимо заметить, что уменьше-

ние числа анализируемых особей уменьшает силу проводимых тестов,

т.е. настоящие

QTL

будут «утеряны», особенно те, которые производят

слабый эффект, а выявленные

QTL

не будут достоверными. Риск, что

установленный

QTL

является фальшивым позитивом, равен выбранной

исследователем ошибке

типа α, и не зависит от размера популяции.

Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека