35 / 202
33
ных ограничений генетической гипотезы модели
Weir
и
Cockerham [400,
402]
. Вследствие этого последняя модель примиряет оба подхода. Срав-
нения
,
сделанные на основе экспериментальных данных
,
показывают,
что оценка двух параметров (
G
st
и
F
st
) сходится, если число популяций
высоко [
67, 299]
. Как следует из литературных источников, параметры
дифференциации на уровне аллелей и на уровне нуклеотидов инспири-
руют (наполняют своим содержанием) то одну, то другую, то третью,
т.е. одну из трех упомянутых выше моделей, которые далее будут обо-
значены как
NE
для
Nei, WE
для
Weir
и
Cockerham
и
PO
для
Pons
и
Petit.
1.8.2.
Измерение дифференциации внутри маркерных систем
Уравнения (15) и (18) устанавливают общие рамки для выражения
дифференциации, которая может быть применена ко всем маркерам как
на уровне аллелей, так и на уровне нуклеотидов.
1.8
.2.1. Уровень аллелей
Значения
G
st
, полученные вычислением
h
t
и
d
st
при использовании
уравнений (9)
,
(16) или (17), имеют различные меры в соответствии с
избранной (для счисления) моделью. Так же
,
как и в случае определения
разнообразия, дистанция между аллелями может быть введена (уравне-
ние
(10)
) аналогичным образом, как это было сделано в рамках модели
WE [125]
и модели РО [
299]
. Случай микросателлитов является особым.
Так, например, если в качестве рабочей принята модель последователь-
ных мутаций, то дифференциация может быть вычислена принятием
различий в числе единиц повторов в качестве дистанции между аллеля-
ми. Методы оценки
,
представленные в литературе и примененные к
особому случаю микросателлитов
,
были выведены на основе модели
NE
(параметр
R
st
, [344
]) или модели
WE
(параметр Φ
st
, [264]).
1.8
.2.2. Уровень нуклеотидов
Дифференциация на уровне нуклеотидов была получена заменой
членов уравнения выраженных в
h
в уравнении (15) на математические
элементы, приведенные в уравнениях (12) и (14). Такое же математиче-
ское выражение, соответствующее модели
NE
, было введено и
Nei
Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека