ЭлБиб

[273]

, но в качестве элемента γ

. Дифференциация на нуклеотидном

уровне была оценена также и с помощью анализа варианс (параметр β

аналог параметру θ модели

WE) [401]

. Другие доступные методы ин-

спирированы больше моделью РО. Исключая сравнение популяций са-

мих с собой в уравнении (14), ряд авторов [

182, 231]

приблизились к

модели случайных эффектов (

для параметра

введенного ранее,

для параметра введенного позднее). Эти два параметра отличаются друг

от друга только в тех случаях, когда они принимают

либо не принима-

ют в расчет поправку Jukes и Cantor (уравнение

(1)

). В этой связи была

предложена оценочная функция [

175]

без погрешности измерения по

Nei [273]

, которая делает γ

сравнимым с

по

Wright [404].

Точно так же, как и в случае разнообразия,

дифференциация на

нуклеотидном уровне

эквивалентна

дифференциации на уровне аллелей,

если аллели ранжированы (организованы и систематизированы) как

функция их нуклеотидной дивергенции.

Опубликованные экспериментальные результаты относятся глав-

ным образом к данным первичных нуклеотидных последовательностей

[63, 249]

. Тем не менее, метод оценки нуклеотидной дивергенции на ос-

нове анализа рестрикционных фрагментов или случайных амплифика-

ций (уравнение

(4)

) может быть использован для установления нуклео-

тидной дифференциации, но только в том случае, если избранная в ка-

честве рабочей гипотеза имеет к этому отношение.

Теоретически дифференциация относительно независима от типа

использованного маркера, если маркеры нейтральны. Ее значение в

уравнении не находится под влиянием уровня мутаций, если этот уро-

вень ничтожен по сравнению с уровнем миграции (уравнение

(20)).

Следовательно, дифференциация зависит преимущественно от размера

исследуемой популяции и уровня миграции, которые являются посто-

янными факторами, действующими в одном направлении и с одной ам-

плитудой на различные маркеры. Экспериментальные данные, позво-

ляющие сравнивать значения дифференциации, рассчитанной на основе

использования различных маркеров, как правило, подтверждают эти на-

блюдения. Однако для высокополиморфных маркеров (микросателли-

ты) можно ожидать более низкую дифференциацию, чем для других

маркеров, поскольку для них уровень мутаций, как правило, очень вы-

Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека