

32
упрощена, исключена многоступенчатая очистка с применением хлоро-
форма; для всех операций протокола характерны простота и оператив-
ность.
Результаты электрофореза экстрактов, полученных в разных вари-
антах, показали больший количественный выход и лучшее качество
ДНК при использовании навески из средней части проростка, незначи-
тельно превышающей рекомендованный производителем вес в 30 мг,
после выдерживания растительной ткани в морозильной камере от полу-
тора до трех часов. Однако, даже при соблюдении этих условий, ДНК,
выделенная методом балк
-
анализа, уступала по качеству и количеству
полученной из отдельных генотипов каждого сортообразца, что требует
дальнейших исследований по оптимизации применяемого протокола.
Задача оценки генетической изменчивости и идентификации сор-
тов, популяций и форм может быть успешно решена только при выборе
эффективных молекулярных маркеров, позволяющих выявлять высокий
уровень полиморфизма ДНК, анализировать большую часть генома, по-
лучать четко воспроизводимые результаты. Для наших исследований
был выбран микросателлитный
SSR-
анализ, как один из наиболее дос-
тупных, быстрых, воспроизводимых и не требующих использования ра-
диоактивных меток. Микросателлиты состоят из участков ДНК длиной
в две–шесть пар оснований, распространенных в тандемных повторно-
стях по всему эукариотическому геному. Они имеют относительно ма-
лые размеры и могут легко амплифицироваться в процессе ПЦР. Про-
дукты амплификации выявляются с использованием как полиакрила-
мидного, так и агарозного электрофореза.
SSR-
маркеры предпочтитель-
ны для анализа и скрининга биоразнообразия разных видов, что обу-
словлено их гипервариабельностью (имеют десятки аллелей по одному
локусу, отличающихся по числу повторов).
Для повышения достоверности и результативности оценки гене-
тических особенностей исследуемого материала важна не только при-
меняемая система маркирования, но и решение проблемы адекватного
подбора праймеров. Опыт применения ДНК
-
маркеров показывает, что
праймеры, позволяющие различать виды, не всегда подходят для иден-
тификации внутривидового полиморфизма и наоборот.
В наших исследованиях использовались семь
SSR-
праймеров.
В выборках изучаемых образцов клевера лугового выявляли уникаль-
ные фрагменты амплифицированной ДНК, свойственные только от-
дельным образцам. Три из испытанных праймеров (42 %) позволили по-
лучить отчетливые ДНК
-
профили в зоне от 120 до 170 пар оснований.
Обнаружены специфичные продукты ПЦР размером 150 и 170 нуклео-
тидных пар у образцов из Чили, Бурятии и Белоцветкового с праймером
RCS
1307 (рис. 1, лунки 1, 4, 7 соответственно).
Электронная Научная СельскоХ
дио
озяйственная Библиотека