47 / 202
45
локусов (табл.
5
). Следует заметить, что доверительные интервалы не
симметричны (даже если установленная дистанция равна 50%). Напри-
мер, для 10 маркеров реальная дистанция (для всего генома) равная
30,8% может привести к нулевому значению установленной дистанции
с вероятностью 2,5% [(1 –
0,308)
10
], причем таким образом, что довери-
тельный интервал для нулевой дистанции будет находиться в интервале
от 0% до 30,8%. Для данного числа маркеров равномерное их располо-
жение на генетической карте, по сравнению со случайным распределе-
нием, в целом также повышает точность установления дистанций [
106,
395].
С другой стороны, для увеличения точности установления генети-
ческих дистанций в расчет может быть принята дистанция на карте ме-
жду генетическими маркерами. Для этого, как правило, используют со-
ответствующие статистические подходы
[106].
Таблица
5
Точность установления генетических дистанций между двумя линиями
как функция числа (
N
) использованных для счисления дистанции локусов
(по [
29])
N
D
0%
10%
20%
30%
50%
10
0-30,8
0,2-44,5
2,5-55,6
6,6-65,2
18,8-81,2
20
0-16,8
1,2-31,7
5,7-43,6
11,8-54,3
27,2-72-8
30
0-11,5
2,1-26,5
7,7-38,5
14,7-49,4
31,3-68,7
50
0-7,1
3,3-21,8
10,0-33,7
17,8-44,5
35,6-64,4
100
0-3,6
4,9-17,6
12,7-29,2
21,2-40,0
39,9-60,1
200
0-1,8
6,2-15,0
14,7-26,2
23,7-36,9
42,9-57,1
Генетические дистанции могут служить основой для классифика-
ции интересующего исследователя, например, куратора коллекций или
селекционера, материала. Таким материалом могут быть линии, образ-
цы, популяции и т.п. На сегодняшний день используют различные алго-
ритмы определения генетических дистанций. Наиболее часто применя-
ют такой алгоритм счисления среднего сцепления (обычно называемый
UPGMA
— невзвешенный среднеарифметический парно
-
групповой ме-
тод), в котором дистанция между двумя группами определяется как
средняя дистанция между элементами групп, а также метод
Ward [397],
который минимизирует вариацию внутри формируемых групп. Эти ана-
Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека