ЭлБиб

ISSR-

маркирование — один из наи-

более современных и информативных

подходов для выявления внутривидовой

и межвидовой изменчивости, идентифи-

кации и паспортизации видов, популя-

ций, сортов, линий и иногда индивидов

[22].

Основан на сравнении полимор-

физма длин фрагментов ДНК, находя-

щихся между микросателлитными по-

вторами

С применением

ISSR-

маркеров

проведена оценка биоразнообразия гене-

тических ресурсов ежи сборной [23], ус-

тановлено филогенетическое родство

локальных популяций лисохвоста луго-

вого (

Аlopecurus pratensis

L.) [24].

Метод с использованием

SNP-

марке

ров (однонуклеотидный полиморфизм)

позволяет выявить мутацию единствен-

ного основания между гомологичными

фрагментами ДНК

Характеризуется вы-

сокой стабильностью и воспроизводимо-

стью результатов — в большей степени,

чем это свойственно другим маркерным

системам

в том числе

SSR-

или

AFLP-

маркерам

Однако до настоящего момен-

та технология остается достаточно за-

тратной, так как для разработки

SNP-

маркеров необходимо широкомасштаб-

ное геномное секвенирование. По этой

причине

SNP-

маркирование нечасто ис-

пользуется для анализа растительных

геномов, хотя в последнее время такие

работы стали появляться, в том числе и

при изучении внутрисортовой генетиче-

ской изменчивости кормовых культур,

например, райграса многолетнего

[25;

26].

Объективность и достоверность

оценки генетического разнообразия по-

пуляции зависит не только от исполь-

зуемого для анализа молекулярно

генетического метода, но, в немалой

степени, и от репрезентативности вы-

борки или количества анализируемых

индивидуальностей от исследуемого

объекта. Популяции перекрестноопы-

ляемых видов

включая сорта, природ-

ные популяции или растения разных ви-

дов, обитающие в определенной экоси-

стеме, состоят их множества различных

генотипов и характеризуются высоким

уровнем внутрипопуляционной измен-

чивости

Следовательно, чем большее

количество растений от популяции

включено в исследование по оценке ге-

нетического разнообразия, тем выше ве-

роятность охвата редких аллелей. Гено-

типы или аллели, встречающиеся с час-

тотой не менее 10%, с большой долей

вероятности будут определены при ана-

лизе выборки размером не менее 40 рас-

тений

тогда как для детекции аллелей,

встречающихся с частотой 5%, необхо-

димо проанализировать не менее 100

растений

[27].

Чтобы провести оценку

внутрипопуляционной и межпопуляци-

онной генетической изменчивости таких

видов, как клевер луговой, выборку

формируют, как правило, из не менее

растений на популяцию

в результате до

90% повышается вероятность учета ал-

лелей, встречающихся в популяции с

частотой

10% [28].

Однако на практике

анализ большого числа индивидуально-

стей является дорогостоящим и трудо-

емким процессом. Эффективным подхо-

дом, позволяющим генотипировать пе-

рекрестноопыляемые культуры с наи-

меньшими усилиями, является «балк

стратегия», когда растительный матери-

ал или ДНК нескольких разных растений

большого пула объединяют в один сме-

шанный образец для анализа

[29].

Не-

достаток метода — неизбежная потеря

Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека