ЭлБиб

СОВРЕМЕННОЕ СОСТОЯНИЕ УПРАВЛЕНИЯ ГЕНЕТИЧЕСКИМИ РЕСУРСАМИ ЖИВОТНЫХ

373

степени наблюдаемые взаимодействия представляют

физиологические взаимодействия белок-белок.

Методы, основанные на матрицах, разрабатывают-

ся также для выявления ДНК-белок взаимодействий

vitro

in vivo

(см. обзор Sauer и др., 2005), и идентифи-

кации неизвестных белков, связывающихся с последо-

вательностями, участвующими в регуляции гена. ДНК

микроматрицы эффективно применяются для выявле-

ния ДНК-связывающих комплексов в ядерных экстрак-

тах, тогда как белковые микроматрицы, главным об-

разом, используются для идентификации неизвестных

ДНК-связывающих белков на уровне всего протеома. В

будущем эти два метода будут способствовать выявле-

нию деталей регуляторных сетей транскрипции.

Многие методы предсказания функции белка

основываются на их гомологии с другими белками

и их локализации внутри клетки. Предсказание

функций белка достаточно сложны, и также тре-

буют методов выявления взаимодействия белок-

белок и выявления связывания белков с другими

молекулами, поскольку именно в этих процессах

связывания белки реализуют свою функцию.

Роль биоинформатики

Без возможностей анализа экспоненциально расту-

щего количества биологических данных, развитие

высокопроизводительных технологий было бы бес-

полезным. Эти технологии требуют методов хранения

в электронных базах данных (вставка 78), связанных

с разработкой специального программного обеспече-

ния, позволяющего обновлять, запрашивать и искать

данные. Информация должна быть легкодоступной и

гибкой по отношению к запросам, чтобы можно было

осуществлять поиск информации, котораяможет быть

проанализирована для объяснения метаболических

путей и роли участвующих в них белков и генов.

Для объединения информации из разных источ-

ников и получения новых знаний из существующих

данных биоинформатика является определяющей

областью исследований. Она также обладает мощ-

ным потенциалом для моделирования структур,

функций и динамики молекулярных систем, и, сле-

довательно, служит для формулирования гипотез

и развития экспериментальной работы.

Заключение

Молекулярная характеристика может играть важ-

ную роль в раскрытии истории, оценке разнооб-

разия, самобытности и популяционной структуры

ГРЖ. Она также может помочь избежать избы-

точного инбридинга при генетическом управле-

нии маленькими популяциями. Многие исследо-

вания описывают внутри- и межпопуляционное

разнообразие – некоторые в весьма крупном мас-

штабе. Однако эти исследования фрагментарны,

их трудно сравнивать и обобщать. Более того, не

проведены всесторонние международные обсле-

дования соответствующих видов. По этой при-

чине стратегическое значение имеет разработка

методов объединения существующих, частично

перекрывающихся наборов данных, и обеспече-

ние стандартизации образцов и маркеров для бу-

дущего использования в качестве стандартов для

исследований во всех странах. Сеть лабораторий,

собирающих образцы автохтонной зародышевой

плазмы, которая станет доступной для научного

сообщества на определенных условиях, будет

способствовать выполнению глобального обсле-

дования генетического разнообразия.

Маркерные технологии эволюционируют и, по-

хоже, что микросателлиты последовательно заме-

щаются на SNP. Эти маркеры очень перспективны,

поскольку число их в геноме велико, и они пригод-

ны для автоматизации анализа и генотипирования.

Однако эффективность SNP в изучении разнообра-

зия у видов животных до сих пор остается недоста-

точно исследованной. К этому вопросу необходимо

относиться достаточно критично, для того, чтобы

избежать накопления искаженных данных.

Методы анализа данных также эволюциони-

руют. Новые методы позволяют изучать разноо-

бразие, не прибегая к предположениям a priori о

структуре исследуемой популяции; использовать

разнообразие для выявления адаптивных генов

(например, используя популяционную геноми-

ку, см. вставка 77); обобщать информацию, по-

лученную из различных источников, включая

социально-экономические и экологические пара-

метры, для расстановки приоритетов по сохране-

нию (см. часть Е). Принятие правильной стратегии