XI Съезд Русского ботанического общества
устойчивости клеток листа и корня, свидетельствующее, на наш взгляд, не только о различной способности
этих органов к адаптации, но и, возможно, о разных механизмах, определяющих рост их теплоустойчивости.
Кроме того, изменение устойчивости клеток прогреваемого и непрогреваемых органов указывает на то,
что растение реагирует на неблагоприятное температурное воздействие как единая система.
Работа выполнена при частичной финансовой поддержке (грант РФФИ № 02-04-97519).
ЛИТЕРАТУРА
Радченко СИ
. Температурные градиенты среды и растение. - М .-Л , 1966. - 397 с.
СЕКВЕНИРОВАНИЕ И СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ Н ЕПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ И ГЕНОВ 5.8S
РРНК У ДИКОРАСТУЩИХ ПРЕДСТАВИТЕЛЕЙ РОДА
A VENA
Тюпа Н. Б.* Ким Е. С., Лоскутов И. Г.*, Родионов А. В.
Ботанический институт им, В.Л. Комарова PAHt г. Санкт-Петербург;
*
Всероссийский НИИ растениеводства им. НИ, Вавилова
,
г. Санкт-Петербург
Последовательности ITS1, лежащая между генами 18S рРНК и 5.8S рРНК и 1TS2, располагающаяся
между геном 5.8S рРНК и геном 26S рРНК, окружены эволюционно консервативными рибсомными генами,
имеют оптимальную для секвенаторов среднего класса длину (около 200-220 п.н. каждая, около 600-700
п.н. вместе с 5.8S рДНК) и относительно быстро изменяются в ходе дивергенции видов. Эти их
характеристики делают ITS-последовательности растений и грибов удобным объектом для сравнительного
исследования (обзоры: Baldwin et al., 1995; Buckler IV, Holtsford, 1996; Hershkovitz, Lewis, 1996; Linder et
al., 2000). В частности, ITS-последовательности неоднократно использовались при молекулярно
филогенетических исследованиях злаков (Buckler IV, Holtsford, 1996; Ainouche M.L., Bayer R.J., 1997;
Grebenstein et al., 1998; Guo et al., 2000; Li, Zhang, 2002).
В данной работе нами проведен сравнительный анализ последовательностей ITS1 и ITS2 и генов
5.8S-pPHK нескольких дикорастущих видов рода
Avena.
В качестве праймеров для ПЦР-амплификации
использовались последовательности ITS 1F 5’-cttggtcatttagaggaagtaa-3’ (Grades, Bruns, 1993) и ITS4 5’-
tcctccgcttattgatatgc-3 ’ (White et al., 1990), исходно предложенные для исследования ITS-последовательностей
грибов, однако, как показали предварительные эксперименты, эффективно работающие и с геномной ДНК
злаков. Были амплифицированы и секвенированы районы 18S рРНК (фрагмент), ITS1, 5.8S рРНК, ITS2,
26S рРНК (фрагмент) - из образцов геномной ДНК
A. wiestii
(геном As, VIR-95, Алжир),
A. hirtula
(As,
VIR-2, Алжир; VIR-2034, Тунис),
A. longiglumis
(Al, VIR-1811, Марокко),
A. damascene
(Ad, VIR-2057,
Марокко),
A
.
canariensis
(Ac, VIR-1811, Алжир),
A. atlantica
(As, VIR-1894, Марокко), а также ITS-
последовательности тетраплоидного вида
A. macrostachya
(VIR-1856, Алжир) и нескольких полиплоидных
видов
Avena,
Каждая последовательность секвенировалась в двух направлениях. Длина секвенированных
фрагментов составляла 667-668 нуклеотидов для каждого вида. Ниже представлен фрагмент
секвенированной последовательности ITS1 нескольких видов
Avena:
A.macrostachya
TAGCTCGGTG ATGCGGCTGG CTTGCCGGTC GGTTACCGTG CTGCAAAG
A.damascena
TAGCTTGGGG ACACGACTGG CTTGCTGGCC GCTCCCCTTG CTGCAAAG
A.insularis
TAGCTTGGGG ACACGACTGG CTTGCTGGCC GCTCCCCTTG CTGCAAAG
A.atlantica
TAGCTTGGGG ACACGACTGG CTTGCTGGCC GCTCCCCTTG CTGCAAAG
A,hirtula
TAGCTTGGGG ACACGACTGG CTTGCTGGCC GCTCCCCTTG CTGCAAAG
A.wiestii
TAGCTTGGGG ACACGACTGG CTTGCTGGCC GCTCCCCTTG CTGCAAAG
A.clauda
TAGCTTGGGG ACACGACTGG CTTGCTGGCC GCTCCCCTTG CTGCAAAG
A, longiglumis
TAGCTTGGGG ACACGACTGG CTTGCTGGCC GCTCCCCTTG CTGCAAAG
A.canariensis
TAGCTTGGG- ACACGACTGG CTTGCTGGTC GCTCCCCTTG CTGCAAAG
A.sterilis
TAGCTTGGGG ACACGACTGG CTTGCTGGCC GCTCCCCTTG CTGCAAAG
A.sativa
TAGCTTGGGG ACACGACTGG CTTGCTGGCC GCTCCCCTTG CTGCAAAG
Сравнение последовательностей показало, что все исследованные нами представители
Avena,
кроме
A. macrostahya,
судя по последовательностям ITS1 и ITS2, представляют собой компактную филу, хорошо
поддерживаемую при bootstrap-анализе. При попарном сравнении 11 видов
Avena
без
A, macrostahya
величина р (% дивергировавших нуклеотидов в секвенированном районе), в среднем, составила 0,48 %.
При попарном сравнении A
macrostahya
с остальными видами рода
Avena
величина р-расстояния, в среднем,
составила 7%. Высокий
%
нуклеотидных замен связан с тем, что последовательности диплоидных видов
Avena
имеют много синапоморфий, отличающих их от последовательностей ITS представителей других
278
Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека