Table of Contents Table of Contents
Previous Page  280 / 512 Next Page
Information
Show Menu
Previous Page 280 / 512 Next Page
Page Background

XI Съезд Русского ботанического общества

устойчивости клеток листа и корня, свидетельствующее, на наш взгляд, не только о различной способности

этих органов к адаптации, но и, возможно, о разных механизмах, определяющих рост их теплоустойчивости.

Кроме того, изменение устойчивости клеток прогреваемого и непрогреваемых органов указывает на то,

что растение реагирует на неблагоприятное температурное воздействие как единая система.

Работа выполнена при частичной финансовой поддержке (грант РФФИ № 02-04-97519).

ЛИТЕРАТУРА

Радченко СИ

. Температурные градиенты среды и растение. - М .-Л , 1966. - 397 с.

СЕКВЕНИРОВАНИЕ И СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ Н ЕПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ И ГЕНОВ 5.8S

РРНК У ДИКОРАСТУЩИХ ПРЕДСТАВИТЕЛЕЙ РОДА

A VENA

Тюпа Н. Б.* Ким Е. С., Лоскутов И. Г.*, Родионов А. В.

Ботанический институт им, В.Л. Комарова PAHt г. Санкт-Петербург;

*

Всероссийский НИИ растениеводства им. НИ, Вавилова

,

г. Санкт-Петербург

Последовательности ITS1, лежащая между генами 18S рРНК и 5.8S рРНК и 1TS2, располагающаяся

между геном 5.8S рРНК и геном 26S рРНК, окружены эволюционно консервативными рибсомными генами,

имеют оптимальную для секвенаторов среднего класса длину (около 200-220 п.н. каждая, около 600-700

п.н. вместе с 5.8S рДНК) и относительно быстро изменяются в ходе дивергенции видов. Эти их

характеристики делают ITS-последовательности растений и грибов удобным объектом для сравнительного

исследования (обзоры: Baldwin et al., 1995; Buckler IV, Holtsford, 1996; Hershkovitz, Lewis, 1996; Linder et

al., 2000). В частности, ITS-последовательности неоднократно использовались при молекулярно­

филогенетических исследованиях злаков (Buckler IV, Holtsford, 1996; Ainouche M.L., Bayer R.J., 1997;

Grebenstein et al., 1998; Guo et al., 2000; Li, Zhang, 2002).

В данной работе нами проведен сравнительный анализ последовательностей ITS1 и ITS2 и генов

5.8S-pPHK нескольких дикорастущих видов рода

Avena.

В качестве праймеров для ПЦР-амплификации

использовались последовательности ITS 1F 5’-cttggtcatttagaggaagtaa-3’ (Grades, Bruns, 1993) и ITS4 5’-

tcctccgcttattgatatgc-3 ’ (White et al., 1990), исходно предложенные для исследования ITS-последовательностей

грибов, однако, как показали предварительные эксперименты, эффективно работающие и с геномной ДНК

злаков. Были амплифицированы и секвенированы районы 18S рРНК (фрагмент), ITS1, 5.8S рРНК, ITS2,

26S рРНК (фрагмент) - из образцов геномной ДНК

A. wiestii

(геном As, VIR-95, Алжир),

A. hirtula

(As,

VIR-2, Алжир; VIR-2034, Тунис),

A. longiglumis

(Al, VIR-1811, Марокко),

A. damascene

(Ad, VIR-2057,

Марокко),

A

.

canariensis

(Ac, VIR-1811, Алжир),

A. atlantica

(As, VIR-1894, Марокко), а также ITS-

последовательности тетраплоидного вида

A. macrostachya

(VIR-1856, Алжир) и нескольких полиплоидных

видов

Avena,

Каждая последовательность секвенировалась в двух направлениях. Длина секвенированных

фрагментов составляла 667-668 нуклеотидов для каждого вида. Ниже представлен фрагмент

секвенированной последовательности ITS1 нескольких видов

Avena:

A.macrostachya

TAGCTCGGTG ATGCGGCTGG CTTGCCGGTC GGTTACCGTG CTGCAAAG

A.damascena

TAGCTTGGGG ACACGACTGG CTTGCTGGCC GCTCCCCTTG CTGCAAAG

A.insularis

TAGCTTGGGG ACACGACTGG CTTGCTGGCC GCTCCCCTTG CTGCAAAG

A.atlantica

TAGCTTGGGG ACACGACTGG CTTGCTGGCC GCTCCCCTTG CTGCAAAG

A,hirtula

TAGCTTGGGG ACACGACTGG CTTGCTGGCC GCTCCCCTTG CTGCAAAG

A.wiestii

TAGCTTGGGG ACACGACTGG CTTGCTGGCC GCTCCCCTTG CTGCAAAG

A.clauda

TAGCTTGGGG ACACGACTGG CTTGCTGGCC GCTCCCCTTG CTGCAAAG

A, longiglumis

TAGCTTGGGG ACACGACTGG CTTGCTGGCC GCTCCCCTTG CTGCAAAG

A.canariensis

TAGCTTGGG- ACACGACTGG CTTGCTGGTC GCTCCCCTTG CTGCAAAG

A.sterilis

TAGCTTGGGG ACACGACTGG CTTGCTGGCC GCTCCCCTTG CTGCAAAG

A.sativa

TAGCTTGGGG ACACGACTGG CTTGCTGGCC GCTCCCCTTG CTGCAAAG

Сравнение последовательностей показало, что все исследованные нами представители

Avena,

кроме

A. macrostahya,

судя по последовательностям ITS1 и ITS2, представляют собой компактную филу, хорошо

поддерживаемую при bootstrap-анализе. При попарном сравнении 11 видов

Avena

без

A, macrostahya

величина р (% дивергировавших нуклеотидов в секвенированном районе), в среднем, составила 0,48 %.

При попарном сравнении A

macrostahya

с остальными видами рода

Avena

величина р-расстояния, в среднем,

составила 7%. Высокий

%

нуклеотидных замен связан с тем, что последовательности диплоидных видов

Avena

имеют много синапоморфий, отличающих их от последовательностей ITS представителей других

278

Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека