Аграрная наука Евро-Северо-Востока. Т. 22, N 2

ОБЗОРЫ / RE VI EW S Аграрная наука Евро - Северо - Востока / 184 Agricultural Science Euro -North-East. 2021;22(2):167-187 много разных малочисленных пород одного вида, а объединить породы со слабой генети- ческой дифференциацией ( высоким генетиче- ским сходством) . По двухфакторному AMOVA была получена статистически не значимая оценка STR - дифференциации породных выбо- рок в пределах регионов, т.е. региональные выборки представляли генофонды двух попу- ляций . Финская Ассоциация Племенного Ско- товодства ( Faba ) уже в 2010 году де-факто объединила A YR, RDAT и RSH породы , присоединив их к международной племенной организации Vik ingGenetics . Также голштин- ская порода считается транснациональной, в которой немецкая и нидерландская субпопу- ляции являются её составными частями. Фик- сация постфактум генетических взаимоот- ношений, сформировавшихся при практиче- ском разведении и селекции рассматриваемых пород, – это сопутствующий результат наших исследований. Анализируемые породные выборки представляли интерес не только как объекты для сравнительных исследований методов оценки STR - дифференциации попу- ляций . Они интересны и как модельные попу- ляции для исследования разных сценариев сохранения генофонда исчезающих пород. Допустим, что имеем не семь реальных породных выборок, а семь гипотетических местных малочисленных пород с полученной выше структурой генетических взаимоотно- шений. Так как генетическое сходство A YR, RDAT и RSH пород очень высокое, то их можно объединить и сформировать новую RED - породу. Аналогично и по H -DEU , H - NLD и H -USA породам – сформировать HOL - породу. Предположим, что мы решились на такой «породообразовательный процесс» . Как он отразится на внутри - и межпородном генетическом разнообразии новой породной структуры ( JE R , RED, HOL) ? Усреднённое по A YR, RDAT и RSH породам число аллелей на локус (n a ) было 5,1, эффективных аллелей ( n e ) – 3,3, ожидаемая гетерозиготность ( He ) – 65,8 %. В « новой» RED - породе эти показатели составили, соот- ветственно, 6,7 , 3,5 и 68,3 %. Усреднённые по H -DEU , H -N LD и H -USA породам показатели были : n a = 5,5, n e = 3,8, He = 70,2 %. В «новой» HOL - породе они составили, соответственно, 7,0 , 4,1 и 72,4 %. Показатели генетического разнообразия RED и HOL пород ожидаемо возрасли: по n a в среднем на 29 %, n e – на 7 %, He – на 3 ,5 % (заметим, объединение увеличи- ло и численность « новых» популяций, что немаловажно) . Сводные оценки генетической диффе- ренциации гипотетических местных пород ( семи до объединения) были: по F ST(W& C ) – 0,108 , F′ ST(W& C ) – 0,351 , D EST – 0,2 92 с 95 % CI 0,244.. .0,339 (D EST из работы [22]). После объединения (3 породы) оценки составили, соответственно, 0,140, 0,453 и 0,427 с 95 % CI 0,348...0,493. Объединение пород с высоким генетическим сходством увеличило STR - диф - ференциацию новой породной структуры, именно: оценки F ST(W& C ) и F′ ST(W& C ) повысились на 29 %, D EST – на 46 %. Здесь следует отме- тить, что статистики F ST(W& C ) и F′ ST(W& C ) отно- сятся к семейству « мер фиксации», т. к. они фактически измеряют близость аллелей к их фиксации в каждой субпопуляции или степень завершения процесса фиксации (аллель достиг частоты 1), а не абсолютную дифференциацию. D EST - статистика относится ко второму семей- ству мер – «аллельной дифференциации», когда дифференциация – это отсутствие какой - либо общей аллели (- ей) в субпопуляциях. Эта стати- стика равна 1 , когда аллелофонд каждой субпо- пуляции состоит полностью из приватных аллелей, и равна 0 , когда все субпопуляции имеют одни и те же аллели с одинаковыми частотами [4]. Исходя из 95 % CI по D EST мож- но полагать, что общих аллелей в аллелофондах трёх «новых» пород 50-65 % ( до объединения их было 66 -76 %). Парные по породам GD были (в круглых скобках – усреднённые оценки из анализов по семи породным выбор- кам , в квадратных скобках – % снижения после объединения ): F ST(W& C ) F′ ST(W& C ) D EST JER – RED 0,2 34 (0,247) [-5, 3] 0,652 (0,661) [-1,4] 0,547 (0,551) [-0,7] JER – HOL 0,171 (0,187) [-8,6] 0,513 (0,528) [-2,8] 0,413 (0,420) [-1,7] RED – HOL 0,105 (0,113) [-7,1] 0,366 (0,385) [-4,9] 0,292 (0,307) [-4,9] Наибольшие ST R - дистанции были меж- ду JER и RED породами, в 2 раза короче (в среднем) – между породой RED и HOL . В противоположность сводным оценкам диф- ференциации, имело место небольшое сокра- щение парных GD : в среднем на 7 % по F ST(W& C ) оценщику, на 3 % – по F′ ST(W& C ) и на 2,4 % – по D EST . Между JER и RED породами Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека