Аграрная наука Евро-Северо-Востока. Т. 22, N 2

ОБЗОРЫ / REV IE WS Аграрная наука Евро - Северо - Востока / Agricultural Science Euro-North-East. 2021;22(2):167-187 185 STR - дистанции сократились в среднем на 2,5 %, между JER и HOL – на 4,4 %, RED и HOL – на 5,6 %. Изменился и вклад пород в STR - раз - нообразие. Так, до объединения вклад JER породы (выборки) по PCoA оценивался в 3 8,1 %, суммарный вклад A YR, RDAT и RSH пород был 3 7,5% , а H -DEU , H - NLD и H -USA пород – 24,4 %. После объединения вклад JER - породы составил 43,5 % (+ 5,4 процентных пункта , п.п.) , вклад RED - породы – 36,3 % ( - 1,2 п.п.) и вклад HOL - породы 20,2 % (- 4,2 п.п.) . Заключение. Три подхода к дисперси- онному анализу микросателлитной изменчи- вости (A M OVA): по матрице дистанций между аллелями ( расчёт F ST (W&C) - статистики ), по мат- рице дистанций между генотипами (Φ PT ) и матрице различий в размерах аллелей ( R ST ), по всей вероятности, приводят к достаточно близким сводным оценкам генетической диф- ференциации пород . При этом разные компью - терные программы обеспечивают получение схожих AMOVA - оценок . Оценки по AMOVA сопоставимы с G- оценками Нея (Nei) на базе ожидаемой гетерозиготности. Если число локусов для анализа небольшое, то R ST - оценки могут быть смещёнными . Статистики F ST (W&C) и Φ PT подвержены влиянию уровня внутрипо- родной гетерозиготности и нуждаются в стан- дартизации, которая может значительно повы- сить первоначальные оценки. Стандартизиро- ванные оценки хорошо согласуются с оцен - ками, рассчитанными методами Джоста (Jost) и Морисита - Хорна (Morisita - Horn ), на которые влияния уровня внутрипородной гетерозигот- ности нет . Сопряжённость матриц парных по породам генетических дистанций, рассчитан- ных с использованием разных мер, высокая. Их PCoA - проекции на 2D плоскости сопоста- вимы : разные подходы и методы приводят к сходным структурам пространственных взаимоотношений между породами . Двухфак- торный AMOVA позволяет количественно оценить как генетические различия между регионами с разными методами разведения и/или селекции пород, так и генетические раз- личия между породами в пределах регионов . Объединение [ вытесняемых ] пород с большим генетическим сходством (малыми генетиче- скими дистанциями) может способствовать увеличению аллельного разнообразия «новых» пород и усилению их дифференциации. References 1. Wright S. Isolation by distance. Genetics. 1943;28(2):114 - 138. URL : https://www.genetics.org/content/28/2/114 2. Wright S . The genetical st ruc ture of populations. Ann. Eugen. 1951;15 (1) :323 - 354. DOI : https://doi.org/10.1111/j.1469 - 1809.1949.tb02451.x 3. Кузнецов В. М. F - статистики Райта: оценка и интерпретация. Проблемы биологии продуктивных животных. 2014; (4):80- 104. Режим доступа : https://elibrary.ru/item.asp?id=22833217 Kuznetsov V. M. F-statistiki Rayta: otsenka i interpretatsiya. [ Wright’s F - statistics: estimation and interpre- tation ]. Problemy biologii produktivnykh zhivotnykh . 2014; (4):80- 104. (In Russ.). URL : https://elibrary.ru/item.as p?i d=22833217 4. Jost L., Archer F., Flanagan S., Gaggiotti O., Hoban S., Latch E. Differentiation measures for conservation genetics. Evol. Appl. 2018;11(7):1139 - 1148. DOI : https://doi.org/10.1111/eva.12590 5. Balloux F., Lugon - Moulin N. The estimation of po pulation differentiation with microsatellite markers. Mol. Ecol. 2002;11(2):155 - 165. DOI : https://doi.org/10.1046/j.0962 - 1083.2001.01436.x 6. Wright S. Evolution and the genetics of populations. Vol. 4. Variability within and among natural pop ula- tions. Uni v. Chicago, 1978. 590 p. 7. Nei M. Analysis of gene diversity in subdivided populations. Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1973;70(12/1):3321 - 3323. DOI: https://doi.org/10.1073/pnas.70.12.3321 8. Nei M., Chesser R. K. Estimation of fixation indexes and gene div e rsities. A nn . Hum. Genet . 1983;47(3):253 - 259. DOI : https ://doi .org /10.1111/ j.1469- 1809.1983.tb00993.x 9. Кузнецов В. М. Методы Нея для анализа генетических различий между популяциями. Проблемы биологии продуктивных животных. 2020;(1):9 1- 110. Режим доступа : https :// e library .ru /item .asp? id=43811467 Kuznetsov V. M. Metody Neya dlya analiza geneticheskikh razlichiy mezhdu populyatsiyami . [Nei’s methods for analyzing genetic differences between populations]. Problemy biologii produktivnykh zhivotnykh = Problems of Productive Animal Biology. 2020;(1):91 - 110. (In Russ.). URL : https://elibrary.ru/item.asp?id=43811467 10. Hedrick P. W. A standardized genetic differentiation measure. Evolution. 2005;59(8):1633 - 1638. URL : https://www.jstor.org/stable/34490 70 11. Meirm ans P. G., Hedrick P. W. Assessing population structure: FST and related measures. Mol. Ecol. Res. 2011;11(1):5- 18. DOI : https://doi.org/10.1111/j.1755 - 0998.2010.02927.x 12. Jost L. G ST and its relatives do not measure differentiation. Mol. Ecol. 2008;1 7(18):4015-4026. DOI : https://doi.org/10.1111/j.1365 - 294X.2008.03887.x Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека