Аграрная наука Евро-Северо-Востока. Т. 22, N 2

ОБЗОРЫ / RE VI EW S Аграрная наука Евро - Северо - Востока / 182 Agricultural Science Euro -North-East. 2021;22(2):167-187 Рис. 7. PСoA-декомпозиция общей дисперсии по разным GD-матрицам (%): А – дисперсии по 1, 2 и ( 1+2) координатам; B – дисперсия по породам (общая); C – дисперсия по породам для 1-ой координаты; D – дис - персия по породам для 2-ой координаты. Цифры в легенде – % учтённой дисперсии в зависимости от метода / Fig. 7. PCoA-decomposition of the total variance for different GD matrices (%): A – variance for 1, 2 and (1+2) coordinates; B – variance for breeds (total); C – variance for breeds for the 1st coordinate; D – variance for breeds for the 2nd coordinate. Numbers in the legend – % of the calculated variance, depending on the method Шестая диаграмма – это проекция матрицы GD по Джосту (D EST ), в основе расчёта кото- рой вариация эффективного числа аллелей. Как и в первых четырёх диаграммах, инфор- мативность (состоятельность) PСoA была высокой ( 96,8 и 97,7 %). Также имело место хорошее соответствие ординаций с таковыми в трёх первых диаграммах . Рисунок 7 иллюстрирует информатив- ность P С oA и вклады породных выборок в дисперсию 1 и 2 координат при использовании разных мер GD. Coord.1 объясняла 64-8 3 % общей дисперсии данных (с max по метрике linF ST(W&C) ; рис . 7А ) , Coord .2 – 16- 3 2 % ( с max по метрике F′ ST(W&C) ). Наибольший вклад в об- щую дисперсию F - матриц GD вносила JER - вы - борка – 3 7-44 % ( рис . 7 В). Затем следовали вы- борки RSH – 16-20 % и R DAT – 12-1 3 % . Вклад AYR - выборки и голштинских «экотипов» был на уровне 2 -10 %. По linR ST - матрице вклады породных выборок были более выравненными: AYR и JER – 21 и 20 %, H - NLD, RDAT и H -DEU – 11-16 %, RSH и H -USA – 6 и 9 %. Вкла- ды породных выборок в дисперсию Coord .1 были, примерно, пропорциональны предыду- щим (рис . 7С). В дисперсию Coord.2 (рис . 7D ) по F - матрицам наибольшие вклады вносили голштинские «экотипы» (2-9 %) , в то время как по linR ST - матрице – JER - выборка (18 %). Двухфакторный AMOVA . Ординация породных выборок по всем матрицам GD была в общем сходной: выделились кластер « красных» пород , кластер голштинских « эко- типов» и ветка джерсейской породы . Класте- ры (определим их как « регионы» ) включали по три породных выборки. Это позволило провести двухфакторный AMOVA с разложе- нием STR - изменчивости на межрегиональный и межпородный в пределах регионов компо- ненты . Результаты обобщены в таблице 7. Суммарные оценки дифференциации были на уровне полученных ранее величин : до стандартизации 0,1 08 при р perm = 0,001, после стандартизации – 0, 384 ( по 7 породным выборкам F′ ST(W&C) = 0,351). Доминировало региональное различие, которое составляло около 90 % от общей дифференциации. В пре- делах регионов дифференциация породных выборок была незначительной и статистически незначимой ( р perm = 0,0 63). Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека