ЭлБиб

239

3. Нуклеотидные замены (SNP), выявленные при сравнении последовательно-

сти гена Srlk у четырех генотипов люцерны посевной, контрастных по устой-

чивости к солевому стрессу, и CAPS маркеры, позволяющие их идентифициро-

вать

(серым цветом выделены несинонимичные SNP)

Позиция

кодона

(н.п.)

sativa-

Nadezhda

falcata-

1674

sativa-

Tibetskaya

sativa-

Severnaya

Амино-

кислота

CAPS

187-189

GTT

GCT

GTT Val/Ala

—

421-423

CAT

CAC

CAT

His

OliI

477-479

AGT

ACT

ACT Ser/Thr

MslI

724-726

GGA GGA

GGT

GGA Gly

—

901-903

ACG ACG

ACA

ACG Thr

—

934-936

ACA

ACG ACG ACG Thr

—

949-951

GCG GCG

GCT

GCG Ala

CviTI

961-963

GCG GCG

GCT

GCG Ala

AciI

982-984

ACG

ACA

ACG

ACA

Thr

Hpy99I

985-987

CTC

CTT

CTA

CTT

Leu

Cac8I,

BstUI

1018-

1020

GGG GGG

GGT

GGG Gly

BsaXI

1057-

1059

CAG

CAA

CAG

CAA

Gln

—

проведения полимеразно-цепной реакции и последующего ре-

стрикционного анализа.

Два несинонимичных SNP, отличающие наиболее соле-

устойчивый сорт Тибетская и наиболее солечувствительный

сорт Надежда, изменяют аминокислотный состав кодируемого

белка. Потенциальное значение этих нуклеотидных замен мо-

жет быть велико, учитывая особую важность участка полипеп-

тидной цепи, которую они кодируют. Сигнальный белок Srlk,

длиной в 604 аминокислотных остатков, встроен в клеточную

мембрану и имеет три домена: 1) внеклеточный (экстрацеллю-

лярный) домен (с 1 по 221 аминокислоту), 2) трансмембранный

домен, непосредственно встроенный в клеточную мембрану

(222-244), и 3) внутриклеточный цитоплазматический домен

(307-581). Из них экстрацеллюлярный домен представляет со-

бой собственно сигнальный пептид, ответственный за восприя-

тие сигнала (extracellular ligand binding protein), и именно в нем

обнаруженные нуклеотидные замены ведут к замене амино-

кислоты валина на аланин (позиция 63) в случае солеустойчи-

Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека