ЭлБиб

143

идентификация генов

кандидатов. Такой подход обычно состоит из

двух фаз. Поиск гена

кандидата посредством оценки генов картирован-

ных около QTL локуса с целью нахождения гена, который сильнее всего

генетически связан с признаком. Вторая фаза выявления гена

кандидата

заключается в установлении того факта, что его молекулярный поли-

морфизм имеет эффект воздействия на генетическую изменчивость при-

знака. Описанная выше процедура и есть процедура известная как пози-

ционная идентификация гена

кандидата. Другой не исключающий по-

зиционной идентификации метод (подход), названный «функциональ-

ная идентификация гена

кандидата», основывается на

a priori

выборе

гена(ов), функционально связанного с признаком. Этот подход, который

может пренебрегать QTL шагом, широко применяется в исследованиях

генома человека. Корреляция между степенью проявления признака и

аллельным полиморфизмом гена

кандидата обеспечивает строгий аргу-

мент в оценке степени проявления гена

кандидата

[102, 302]

. У расте-

ний «функциональный подход» может быть проиллюстрирован приме-

ром определения роли полиморфизма р1 — гена, кодирующего транс-

крипционный фактор, который в свою очередь определяет содержание

майзина в шелковидных нитеобразных пестиках початков неспелой ку-

курузы

[62].

«Позиционный подход» предпочтителен в случае использования

практически изогенных линий (

NIL

), которые отличаются друг от друга

лишь отдельными интересующими исследователя зонами хромосом.

Для получения посредством рекомбинации таких линий с редуцирован-

ным размером зон необходимо проведение возвратного скрещивания,

что, в конечном счете, позволяет проводить прямую идентификацию

гена. В ряде удачно поставленных экспериментов

[135]

было продемон-

стрировано, что желаемый аллельный эффект в QTL, отвечающем за

содержание глюкозы и фруктозы у томата, определяется единичной

нуклеотидной заменой в 484 пар нуклеотидном (п.о.) районе, охваты-

вающем экзон и интрон инвертазы специфичной для плодов. Более точ-

ные исследования выявили, что этот район являлся горячей точкой ре-

комбинации. Важной особенностью этой работы явилось то, что QTL

были определены не в результате использования

RIL

. Для идентифика-

ции QTL авторы, посредством системной интрогрессии фрагментов

Эле тронная Научная СельскоХозяйствен ая Библиотека