NED365343NED

78 ∑ ∑ = = − = L l n a a y a x xy l l l l f f L D 1 1 2 ) ( 2 1 где L — число локусов, использованных для вычисления дистанции, n l — общее число аллелей в локусе l , а l a x f (или l a y f ) — частота аллеля a l в локусе l в популяции x (или y ). В случае чистых линий D xy просто равно пропорции локусов, для которых линии зафиксировали различ- ные аллели. Когда информация не может быть проанализирована в пре- делах аллельных вариаций (например, когда используется кодировка «присутствие/отсутствие» полос), то в таких случаях обычно использу- ется дистанция по Nei и Li (Nei, Li, 1979). С другой стороны, если в зна- чениях аллельных вариаций можно анализировать только какую-то часть информации, то в этом случае может оказаться полезным опреде- ление взвешенных средних дистанций по Rogers и Nei и Li (Dillmann et al., 1997a). Точность установления дистанции увеличивается с числом принятых во внимание локусов (табл. 4.1). Следует заметить, что дове- рительные интервалы не симметричны (даже если установленная дис- танция равна 50 %). Например, для 10 маркеров реальная дистанция (для всего генома) равная 30,8 % может привести к нулевому значению ус- тановленной дистанции с вероятностью 2,5 % [(1 – 0,308) 10 ], причем та- ким образом, что доверительный интервал для нулевой дистанции будет находиться в интервале от 0 до 30,8 %. Для данного числа маркеров равномерное их расположение на генетической карте, по сравнению со случайным распределением, в целом также повышает точность установ- ления дистанций (Dillmann et al., 1997b; Wang, Bernardo, 2000). В то же время, для увеличения точности установления генетических дистанций в расчет может быть принята дистанция на карте между генетическими маркерами. Для этого, как правило, используют соответствующие ста- тистические пособия (Dillmann et al., 1997b). 4.1. Точность установления генетических дистанций между двумя линиями как функция числа ( N ) использованных для счисления дистанции локусов (по Bar-Hen, Charcosset, 1994) N D 0% 10% 20% 30% 50% 10 0–30,8 0,2–44,5 2,5–55,6 6,6–65,2 18,8–81,2 20 0–16,8 1,2–31,7 5,7–43,6 11,8–54,3 27,2–72–8 30 0–11,5 2,1–26,5 7,7–38,5 14,7–49,4 31,3–68,7 50 0–7,1 3,3–21,8 10,0–33,7 17,8–44,5 35,6–64,4 100 0–3,6 4,9–17,6 12,7–29,2 21,2–40,0 39,9–60,1 200 0–1,8 6,2–15,0 14,7–26,2 23,7–36,9 42,9–57,1