NED365343NED

79 Генетические дистанции могут служить основой для классифика- ции интересующего исследователя, например, куратора коллекций или селекционера, материала. Таким материалом могут быть линии, образ- цы, популяции и т. п. На сегодняшний день используют различные алго- ритмы определения генетических дистанций. Наиболее часто применя- ют такой алгоритм счисления среднего сцепления (обычно называемый UPGMA — невзвешенный парно-групповой метод), в котором дистан- ция между двумя группами определяется как средняя дистанция между элементами групп, а также метод Ward (1963), который минимизирует вариацию внутри формируемых групп. Эти анализы могут быть допол- нены другими наглядными подходами установления степени генетиче- ской изменчивости, такими как анализ главных компонент или факто- риальный анализ соответствий. 4.7. Взаимоотношения между молекулярной дивергенцией, феноти- пической дивергенцией и сопроисхождением Достоверная корреляция между дистанцией и сопроисхождением обычно отмечается, когда в расчет берут достаточно большое число ге- нетических маркеров (см. обзор Melchinger, 1999). Низкие или короткие дистанции могут наблюдаться только для высоких уровней сопроисхо- ждения (см., например, Smith et al., 1990). Тем не менее, для схожих степеней сопроисхождения дивергенция между двумя особями, как пра- вило, не одна и та же из-за генетического дрейфа и эффекта отбора. На- пример, в случае получения рекомбинантных инбредных линий посред- ством последовательного самоопыления потомства, полученного от скрещивания линий А и Б, некоторые линии получаются ближе к А, чем другие, даже если все линии имеют один и тот же коэффициент сопро- исхождения с А. Это может быть проиллюстрировано результатами ра- боты (Bernardo, Kahler, 2001), в которой показано, что у кукурузы вклад данного родителя в полученные от него инбредные линии, подобным упомянутому выше способом, может варьировать между 80 и 20 %. Если говорить об информации о сопроисхождении, то при ее получении гене- тические маркеры имеют явное преимущество, поскольку принимают во внимание эффекты дрейфа и селекционного отбора и, вследствие этого, обеспечивают более аккуратную оценку генетической схожести. Во многих исследованиях делались попытки установить точные взаимоотношения между индексами дистанций, выявленными с помо- щью генетических маркеров. Первоначально в таких работах использо- вали изоферментные маркеры (Damerval, De Vienne, 1985). В последст- вии стали применять молекулярные маркеры (Bar-Hen, Charcosset, 1994; Moser, Lee, 1994; Burstin et al., 1995; Dillmann et al., 1997a; Burstin, Charcosset, 1997). В целом, если результаты анализов изобразить графи-

RkJQdWJsaXNoZXIy