NED360717NED
По мнению ряда исследователей [5; 6], основными показателями, характеризующими надежность маркера и его пригодность для успеш ного решения поставленных задач, являются кодоминантный характер наследования, возможность выявления высокого уровня полиморфизма, оптимальная частота встречаемости в геноме по хромосомам, селектив но нейтральное поведение и высокая воспроизводимость результатов, т. е. возможность стандартизации метода и осуществления обмена дан ными между лабораториями. На сегодняшний день не существует иде альных молекулярных маркеров, которые полностью бы соответствова ли перечисленным требованиям. Для каждой методики характерны оп ределенные преимущества и недостатки, что и обусловливает примене ние их в соответствии с целью исследований и особенностями генетиче ской структуры исследуемого генома [7; 8; 9]. Одна из первых методик на основе ПЦР получила название RAPD-анализ — полиморфизм рандомно амплифицированных фраг ментов ДНК [10]. В отличие от классической полимеразной цепной ре акции, в этом случае используется один короткий (до 10 нуклеотидов) праймер произвольной структуры, что позволяет избежать предвари тельного клонирования и секвенирования соответствующих фрагментов генома. RAPD-маркеры широко используются в молекулярно генетических исследованиях представителей разных родов растений, особенно с низким уровнем полиморфизма, имеющих склонность к са моопылению или отличающихся большим размером генома. Этот метод не требует наличия высокоочищенной ДНК, которую практически не возможно получить у перекрестноопыляющихся культур, что делает проблему выявления полиморфизма почти неразрешимой. Идеально подходят RAPD-маркеры для анализа растений в тех случаях, когда ис следовать геном другими методами длительно и дорого, т. к. для этой техники характерны быстрота и легкость детектирования, потребность крайне малого количества ДНК для анализа (от 10 до 25 иг). Благодаря этим характеристикам, система маркирования на осно ве RAPD-праймеров завоевала прочные позиции в исследованиях гено мов и в практической селекции, в том числе кормовых культур [11]. Маркеры, полученные этим методом, были использованы для изучения генетического родства между популяциями в люцерне [12] и для ДНК- маркирования хозяйственно ценных признаков и сортовой идентифика ции многолетнего райграса [2]. С помощью RAPD-маркеров проведен анализ генетических вариаций в сортах клевера лугового [13]. Однако данной системе маркирования присущи определенные не достатки. Так, присутствие в RAPD-спектрах полос со сходной молеку лярной массой — не всегда доказательство гомологии. Эти полосы мо гут быть образованы несколькими эмигрирующими продуктами ам 181
RkJQdWJsaXNoZXIy