Table of Contents Table of Contents
Previous Page  64 / 306 Next Page
Information
Show Menu
Previous Page 64 / 306 Next Page
Page Background

ции сортов, маркирования генов хозяйст­

венно ценных признаков, а в некоторых

случаях и для различения отдельных ге­

нотипов.

Наиболее широкое применение среди

методов ДНК-маркирования, нашли осно­

ванные на полимеразной цепной реакции.

В ходе ПЦР многократно увеличивается

количество копий целевых последова­

тельностей. Технология предусматривает

применение особых последовательностей

нуклеотидов - праймеров, фланкирую­

щих амплифицируемую последователь­

ность ДНК. Среди них можно выделить

RAPD, ISSR, RFLP, SSR и др.

Методы ДНК-паспортизации вне­

дрены в селекцию и семеноводство. Так,

в России применяют идентификацию

сортов сои [5], косточковых культур

(сливы, алычи, вишни и черешни) [6] на

основе микросателлитных (SSR) марке­

ров, клевера лугового на основе RAPD-

маркеров [5] и др. Для люпина в России

ранее не был разработан метод ДНК пас­

портизации.

Цель данной работы заключалась в

выявлении генетического полиморфизма

между сортами люпина трех видов: бело­

го

(L. albus),

желтого

(L. luteus)

и узколи­

стного

(L. angustifolius)

методами ДНК-

маркирования.

Геном этой культуры изучен еще не­

достаточно, поэтому для достижения це­

ли необходимо было выбрать метод, ос­

нованный на анализе анонимных после­

довательностей ДНК. Так можно эффек­

тивно оценивать вариабельность большо­

го количества локусов, распределенных

по всему геному. Одним из наиболее эф­

фективных, малозатратных и быстрых

является метод ISSR-PCR.

Основой ISSR-метода, или анализа

полиморфизма

межмикросателлитных

участков ДНК, является ПЦР с одним или

несколькими праймерами длиной в 15-24

нуклеотида, которые состоят из тандем­

ных коротких 2-4 нуклеотидных повторов

и одного-двух селективных (якорных)

нуклеотидов на 3’-конце праймера [7].

Продукты амплификации представляют

собой фрагменты ДНК с неизвестной по­

следовательностью длиной от 100 до

3000 п.н., находящиеся между инверти­

рованными, близко расположенными

микросателлитами. В ходе ISSR-PCR

обычно амплифицируется 25-50 продук­

тов реакции. Количество образующихся

фрагментов может отрицательно корре­

лировать с количеством нуклеотидов в

единице повтора [8]. Метод хорошо вос­

производим в строгих условиях реакции.

Главное преимущество этого метода за­

ключается в том, что он не требует дли­

тельного и дорогостоящего шага конст­

руирования геномных библиотек.

Несмотря на то, что ISSR-маркеры по

большей

части

наследуются

как

доминантные и являются маркерами

случайного типа, они очень часто

используются для различных целей

молекулярно-генетического

анализа

благодаря тому, что позволяют проводить

исследования быстро и не требуют

больших затрат.

Полиморфизм оценивают по присут­

ствию или отсутствию фрагментов ДНК в

спектрах электрофореграмм (рис. 1, 2),

что определяется различиями в последо­

вательностях ДНК сайтов связывания

праймеров.

В работе использовали образцы лю­

пина узколистного: 39 сортов россий­

ской, польской, белорусской и австра­

лийской селекции, 6 гибридных, 5 диких

форм и 7 образцов биологического банка

генов из Белоруссии; 6 сортов люпина

желтого и 17 сортообразцов люпина бе­

лого.

Полимеразную цепную реакцию про­

водили в четырехканальном ДНК-ампли-

фикаторе «Терцик» («ДНК-технология»,

Москва). Использовали ферменты и реак­

тивы НПО «СибЭнзим» (Новосибирск).

Реакционная смесь объемом 20 мкл со­

держала следующие компоненты: 1 ед.

Taq-полимеразы Е338, 2 мкл 10-кратного

SE-буфера AS, 3 ммоль MgCb, 0,2 ммоль

каждого dNTP, 10 пмоль каждого из

праймеров, 20 нг геномной ДНК и НгО.

-

54

-

Научная электронная библиотека ЦНСХБ