Аграрная наука Евро-Северо-Востока. Т. 22, N 2

ОБЗОРЫ / RE VI EW S Аграрная наука Евро - Северо - Востока / 172 Agricultural Science Euro -North-East. 2021;22(2):167-187 Таблица 1 – AMOVA-результаты по программе GenAlEx / Table 1 – AMOVA-results of the program GenAlEx Вариант / Variant Источник / Source df SS MS Est.Var. A M OVA1 AP 6 86,9 14,5 0,46 AI 77 266,7 3, 5 0,0* WI 84 349,5 4,2 4,16 Tot 167 703,1 - 4,62 A M OVA2 AP 6 28,1 4,6 0,24 WP 77 141,7 1,8 1,84 Tot 83 169,8 - 2,08 AMOVA3 AP 6 9199,9 1533,3 49,40 AI 77 27604,1 358, 5 0,0* WI 84 37308,5 444,1 444,15 Tot 167 74112,5 - 493, 56 Примечания: AP – между субпопуляциями, AI – между индивидами, WI – внутри индивидов, WP – внутри популяции, Tot – общая; df – степень свободы; SS – сумма квадратов отклонений; MS – средний квадрат ; Est.Var. – оценка вариансного компонента. * – отрицательное значение вариансы приравнено нулю / Notes : AP – between populations, AI – between individuals, WI – within individuals, WP – within po pulation, Tot – total; df – degree of freedom; SS -s um of squared deviations; MS - mean square; Est.Var. – estim a tion of the variance com- ponent. * – the negative value of the option is equal to zero. Оценки коэффициентов инбридинга и дифференциации . По вариансным компонен- там таблицы 1 получены сводные коэффици- енты инбридинга и генетической дифференци- ации породных выборок ( табл. 2). По A M OV A1 усреднённый внутривыбо- рочный коэффициент инбридинга ( точнее – индекс фиксации , F IS ) составил -9,1 %, что могло бы указывать на некоторый избыток гетерозигот. Но оценка была статистически незначимой ( p perm >0,05). С другой стороны, индекс фиксации в обобщенной выборке (F IT ) был +2,7 %, что могло свидетельствовать о некотором преобладании родственного разведения, если бы оценка была статистиче- ски значимой. В A MOVA3 расчёты основыва- лись не на анализе частот аллелей, как в A MOVA1, а на размере аллелей. Несмотря на это, две оценки, характеризующие систему спаривания, R IS и R IT , оказались относительно близкими к таковым по AMOVA1, соответ- ственно, - 10,7, + 1,5 % и также были статисти- чески незначимыми ( p perm >0,05). В общем, по имеющимся данным в породных выборках статистически значимых отклонений от HWE не было установлено . Таблица 2 – Оценки коэффициентов инбридинга и статистик генетической дифференциации выборок по программe GenAlEx / Table 2 – Estimates of inbreeding coefficients and statistics of genetic differentiation of samples according to the GenAlEx program AMOVA1 AMOVA2 AMOVA3 Stat. Est. p perm Stat. Est. p perm Stat. Est. p perm F IS (f) -0,091 1,000 - - - R IS -0,107 0,985 F IT (F) 0,027 0,081 - - - R IT 0,015 0,375 F ST (W&C) ( θ ) 0,108 0,001 Φ PT 0,115 0,001 R ST 0,110 0,001 Примечания: Stat. – статистика; Est. – оценка; p perm – достигнутый уровень статистической значимости (пермута- ционный тест с 999 перестановками); F IS (R IS ) – коэффициент инбридинга в пределах выборок (= 2 AI σ / 2 Tot σ ); F IT ( R IT ) – коэффициент инбридинга в объединённой выборке (= ( 2 AI 2 AP σ σ + )/ 2 Tot σ ); F ST(W& C ) (θ), Φ PT , R ST – статистики генетической дифференциации породных выборок / Notes: Stat. – statistic; E st . - esti mation; p -perm – ac hieved level of statistical significance (permutation test with 999 per- mutations); F IS (R IS ) – inbreeding coefficient within the samples (= 2 AI σ / 2 Tot σ ); F IT (R IT ) – inbreeding c o efficient in t he combined sample ( = ( 2 AI 2 AP σ σ + )/ 2 Tot σ ); F ST(W&C) ( θ), Φ PT , R ST – statistics of genetic diff erentia tion of breed samples. Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека