Ñàäîâîäñòâî è âèíîãðàäàðñòâî, ¹ 2, 2014
24
Áèîòåõíîëîãèÿ
И.И. Супрун,
кандидат биологических наук, заведующий лабораторией
С.В. Токмаков,
кандидат биологических наук, научный сотрудник
Е.Т. Ильницкая,
кандидат биологических наук, заведующий лабораторией
И.В. Степанов, И.М. Балапанов,
аспиранты
ГНУ СКЗНИИСиВ Россельхозакадемии
E-mail:
kubansad@kubannet.ru, supruni@mail.ru;тел. (861) 252-70-74
УДК 581.1:633/635
ДНК – фингерпринтинг сортов черешни
селекции СКЗНИИСиВ с использованием анализа полиморфизма
микросателлитных локусов
На основе анализа полиморфизма микросател-
литныхлокусоввыполненаДНК-паспортизация
ряда отечественных сортов черешни селекции
СКЗНИИСиВ. Исследованные сорта являются
востребованными в садоводстве в агроклима-
тических условиях Северного Кавказа и Кубани
и представляют селекционный интерес, как
источники полезных адаптивных признаков.
Для анализа полиморфизм исследуемых гено-
типов использовали 7 SSR-локусов, впервые
идентифицированных и картированных в ге-
номе черешни (Ps12a02a, EMPaS02, EMPaS01)
и персика (BPPCT002, UDP96-008, BPPCT038,
CPPCT006). SSR-маркеры были распределены
в мультиплексные наборы, позволяющие ана-
лизировать несколько локусов одновременно.
Оптимальные сочетания SSR – маркеров по-
зволили получать легко интерпретируемые
результаты в ходе фрагментного анализа.
Были подтверждены данные о высоком уров-
не воспроизводимости SSR-маркеров персика
при генотипировании сортов черешни. Так, у
созданных на основе микросателлитных после-
довательностей персика маркеров BPPCT002
и BPPCT038 при анализе выборки сортов
были выявлены четкие ПЦР-продукты, соот-
ветствующие 5 аллелям для каждого локу-
са. Наибольшим уровнемполиморфизма среди
разработанных на персике маркеров обладал
CPPCT006, у которого были выявлены 6 алле-
лей. Количество аллелей, выявленных по всем
изученным SSR-локусам, варьировало от 3 до
DNA fingerprinting of sweet cherry cultivars
bred in North Caucasian Research Institute
of Horticulture and Viticulture was performed
based on the analysis of microsatellite loci.
The studied varieties are demanded in hor-
ticulture in agro-climatic conditions of the
North Caucasus and the Kuban and represent
breeding interest as sources of useful adaptive
traits. To analyze polymorphism of studied set
of genotypes 7 SSR-loci were selected: first
identified and mapped in the genome of cher-
ries (Ps12a02a, EMPaS02, EMPaS01) and
peach (BPPCT002, UDP96-008, BPPCT038,
CPPCT006). Presented microsatellite markers
were grouped into multiplex sets SSR-markers
to analyze several loci simultaneously. Opti-
mal combinations of SSR-markers allowed to
obtain interpretable results in the fragment
analysis. High level of transferability of SSR
markers developed on a peach for genotyping
sweet cherry varieties was confirmed. Thus
at created on the basis of microsatellite se-
quences of a peach markers BPPCT002 and
BPPCT038 in the analysis of sample varieties
were identified clear PCR-products conform-
ing to 5 alleles for each locus. The highest
level of polymorphism markers developed on a
peach had CPPCT006, which had identified 6
alleles. Amount of alleles detected in all stud-
ied SSR-loci ranged: 3 to 6 per locus in the set
of 14 genotypes. For allinvestigated cultivars
unique DNA-profiles were detected. Analysis
*
Работа выполнена при поддержке Российского фонда фундаментальных исследований
(проект № 13-04-02089_А)
Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека