Аграрная наука Евро-Северо-Востока. Т. 21, N 5
ОРИГИНАЛЬНЫЕ СТАТЬИ: РАСТЕНИЕВОДСТВО / ОRIGINAL SCIENTIFIC ARTICLES: PLANT GROWING Аграрная наука Евро-Северо-Востока / Agricultural Science Euro-North-East. 2020;21(5):531-539 531 https://doi.org/10.30766/2072-9081.2020.21.5.531-539 УДК 633.854.54:633.52:575 Генотипирование сортов масличного льна с использованием си- стемы микросателлитных ДНК-маркеров © 2020 С. З. Гучетль , Т. А. Челюстникова ФГБНУ «Федеральный научный центр «Всероссийский научно-исследовательский институт масличных культур имени В.С. Пустовойтa», г. Краснодар, Российская Федерация Тенденция к увеличению площади посева масличного льна требует создания новых сортов с высокими показа- телями экологической пластичности, урожайности и устойчивости к биотическим и абиотическим стрессам. Применение современных биотехнологических подходов, основанных на использовании молекулярных маркеров, мо- жет ускорить оценку генетических различий и определение потенциала, исходного для селекции материала. Целью нашего исследования являлась оценка генотипических параметров некоторых сортов масличного льна селекции Всероссийского научно-исследовательского института масличных культур имени В. С. Пустовойта (ВНИИМК) с использованием системы микросателлитных маркеров. Материалом исследования служили 17 сорто- образцов льна. ДНК выделяли с использованием СТАВ буфера. Для идентификации сортов использовали 11 SSR- локусов. В процессе исследования выявлено 10 полиморфных локусов. Суммарное число учтенных аллелей равно 32. Размер аллелей варьировал в диапазоне 111-210 п. н. Число аллелей на локус варьировало от 2 до 6 со средним значени- ем 3,20. Значение индекса полиморфного информационного содержания (PIC) находилось от 0,29 до 0,75 со средним значением параметра 0,51. Эффективное число аллелей для разных локусов определено в диапазоне 1,40-3,94 со средним значением 2,28. Уровень информативности маркерной системы (PIC 0,51) соответствует таковому для идентификации наборов генотипов из коллекций с ограничением в географическом происхождении. Установлены различия в частоте встречаемости аллелей. Дискриминационный потенциал использованной маркерной системы позволил идентифицировать 15 сортообразцов. Два генотипа, имеющие общее происхождение, были идентичны. Оценена степень генетического родства изученных генотипов льна. Полученные результаты послужат основой для последующего конструирования генетических паспортов сортов масличного льна селекции ВНИИМК. Ключевые слова : лен, ДНК, полимеразная цепная реакция, микросателлиты, идентификация Благодарности : работа выполнена при поддержке Минобрнауки РФ в рамках Государственного задания ФГБНУ «Федеральный научный центр «Всероссийский научно-исследовательский институт масличных культур имени В.С. Пустовойтова» (тема № 0493-2019-0002). Авторы благодарят рецензентов за их вклад в экспертную оценку этой работы. Конфликт интересов : авторы заявили об отсутствии конфликта интересов. Для цитирования : Гучетль С. З., Челюстникова Т. А. Генотипирование сортов льна масличного с использова- нием системы микросателлитных ДНК маркеров. Аграрная наука Евро-Северо-Востока. 2020;21(5):531-539. DOI : https://doi.org/10.30766/2072-9081.2020.21.5.531-539 Поступила: 06.07.2020 Принята к публикации: 26.08.2020 Опубликована онлайн: 22.10.2020 Genotyping oil flax varieties using the microsatellite DNA marker system © 2020. Saida Z. Guchetl , Tatyana A. T. Chelyustnikova V. S. Pustovoit All-Russian Research Institute of Oil Crops, Krasnodar, Russian Federation The tendency to increase crop acreage of oil flax requires the development of new varieties with high indicators of ecological plasticity, productivity and resistance to biotic and abiotic stresses. The application of modern biotechnolog i- cal approaches based on the use of molecular markers can accelerate the assessment of genetic differences and the dete r- mination of potential of the source material for breeding. The research was aimed at assessment of the genotyping param- eters of some oil flax varieties of VNIIMK breeding using the system of microsatellite markers. Seventeen variety samples of flax were used as the material for the research. DNA was isolated using CTAB buffer. Eleven SSR loci were used for the identification of varieties. Ten polymorphic loci were identified during the research. The total number of counted al- leles is 32. The size of alleles varied in the range of 111-210 bps. The number of alleles per locus ranged from 2 to 6 with an average value of 3.20. The value of the index of polymorphic information content (PIC) was from 0.29 to 0.75 with an average parameter value of 0.51. The effective number of alleles for different loci is determined in the range of 1.40-3.94 with an average value of 2.28. The level of information content of the marker system (PIC 0.51) corresponds to that for identifying sets of genotypes from collections with a limitation in geographical origin. There were established differences in the frequency of occurrence of alleles. The discriminatory potential of the used marker system allowed to identify 15 variety samples. Two genotypes with common origin were identical. The degree of genetic relatedness of the studied flax genotypes has been evaluated. The obtained results will serve as the basis for the subsequent construction of genetic pass- ports of oil flax varieties of VNIIMK breeding. Keywords : flax, DNA, polymerase chain reaction, microsatellites, identification Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека
RkJQdWJsaXNoZXIy