ЭлБиб

Аграрная наука Евро-Северо-Востока, №6(61), 2017 г.

роса

, традиционно включаемые в состав сме-

шанных линейных моделей прогнозирования

продуктивных качеств сельскохозяйственных

животных, в условиях поточной технологии не

оказывают существенного влияния на показате-

ли воспроизводительных качеств свиноматок.

Таким образом, обобщенная структура исполь-

зованных смешанных линейных моделей имеет

следующий вид (в нотации языка R):

Reprotrait ~ OporosIndex + Genotype +

/AnimalID

), (1)

где

Reprotrait

– один из признаков воспроизво-

дительного фитнесса: количество поросят при

рождении (гол.), многоплодие (гол.), масса гнез-

да при рождении (кг);

OporosIndex

(фиксиро-

ванный фактор) – порядковый номер опороса;

Genotype

(фиксированный фактор) – генотип по

анализируемому гену (

PRLR, LEP, ESR, FSHb,

MC4R, LIF, POU1F1, GH

), установленный мето-

дом ПЦР-ПДРФ;

AnimalID

(рандомизированный

фактор) – индивидуальный генотип животного.

В процессе исследований анализирова-

ли набор SNP по генам рецептора пролактина

(

PRLR

), лептина (

LEP

), эстрогенового рецепто-

ра (

ESR

), фолликулостимулирующего гормона

бета-субъединицы (

FSHb

), меланокортинового

рецептора 4 (

MC4R

), лейкемия-ингибирующего

фактора (

LIF

), гипофизарного фактора транс-

крипции (

POU1F1

), гормона роста (

). Ме-

тодики определения SNP исследуемых генов

представлены в работах [5-10]. Для каждого

SNP с помощью смешанных линейных моделей

определяли количественную оценку эффекта

генотипов по данному гену и уровень достовер-

ности этой оценки. На основании полученных

значений для каждого SNP принимали решение

о введении его в состав создаваемой панели.

Результаты и их обсуждение.

Оценки

фиксированных эффектов смешанных линейных

моделей вида (1), полученные с использованием

функции

lme

языка R, представлены в таблице

1. Специфика этой функции такова, что в начале

приводится базовая точка отсчета (Intercept) как

оценка одного набора градаций фиксированных

факторов (в качестве Intercept выбран эффект

первого опороса в сочетании с одним из гено-

типов каждого гена), а для остальных градаций

указывается отклонение от этого значения, обу-

словленное их влиянием. В столбце p приведена

достоверность полученных оценок.

Анализируя генетическую структуру

свиней крупной белой породы по гену

PRLR,

установлено наличие трех генотипов. Часто-

та генотипа

PRLR

/АА

составила 1,0%, гено-

типа

PRLR

/АВ – 23,0% и генотипа

PRLR

/ВВ

– 76,0%. Наибольшую частоту имел

PRLR

/В –

0,87, частота аллеля

PRLR

/А

составила 0,13. В

связи с низкой частотой свиньи генотипа АА

были исключены из анализа. Данные в табли-

це 1 свидетельствуют о том, что животные с ге-

нотипом

PRLR

/BB превосходят своих аналогов

с генотипом

PRLR

/AB по всем показателям ре-

продуктивных качеств. Однако статистическая

достоверность установлена только для показа-

теля массы гнезда при рождении.

Полиморфизм гена

LEP

показал наличие

трех генотипов. Наибольшую частоту имел ге-

нотип LEP/ТТ – 47,0%, низкая встречаемость

была у свиней с гетерозиготным генотипом

LEP

/ТС – 40,0%, частота генотипа

LEP

/СС со-

ставила 13,0%. Наибольшей частотой характе-

ризовался аллель

LEP

/Т– 0,67, частота аллеля

LEP

/С составила 0,33. При этом наилучшими

показателями воспроизводительного фитнес-

са обладали животные с генотипом

LEP

/СС.

Гетерозиготные животные также имели замет-

ное превосходство над гомозиготами

LEP

/ТТ.

Разница показателей между генотипами во всех

случаях была достоверной.

Анализ аллелей и генотипов по гену

ESR

позволил установить, что наибольшей частотой

в данной выборке свиней крупной белой поро-

ды характеризовался гетерозиготный генотип

ESR

/АВ - 64,0%, генотип

ESR

/АА имел низкую

частоту и составил 6,0%, частота генотипа

ESR

ВВ

составила 30,0%. Частота аллеля

ESR

/А со-

ставила 0,38, аллеля

ESR

/В – 0,62. Наилучшие

оценки имел генотип

ESR

/ВВ, однако статисти-

ческая достоверность была установлена только

для показателя многоплодия. Более высокие

значения оценок для генотипа

ESR

/АВ, относи-

тельно генотипа

ESR

/АА ни в одном случае не

являлись статистически достоверными.

По гену

FSHb

были установлены три

варианта генотипов

FSHb

/АА,

FSHb

/АВ и

FSHb

/ВВ с частотой 35,0, 52,0, 13,0% соответ-

ственно. Аллель

FSHb

/А встречался с частотой

0,61, аллель

FSHb

/В – 0,39. Разница между эти-

ми генотипами по показателям воспроизводи-

тельного фитнесса оказалась незначительной и

во многих случаях находилась в пределах стати-

стической погрешности. Величина p-значения

для полученных оценок эффектов генотипов

по гену

FSHb

также свидетельствует о высокой

вероятности отсутствия различий между ними.

Анализ генетической структуры свиней

по гену

LIF

показал наличие трех генотипов

LIF

/АА,

LIF

/АВ и

LIF

/ВВ с частотой 29,0,

64,0 и 7,0% соответственно. Наибольшей ча-

стотой характеризовался аллель

LIF

/А – 0,61,

Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека