65 / 86
64
Аграрная наука Евро-Северо-Востока, №6(61), 2017 г.
ЗООТЕХНИЯ
УДК
636.4:636.082.4
Создание панели генетических маркеров для селекции
по воспроизводительному фитнессу свиней крупной белой породы
Колосов Анатолий Юрьевич,
кандидат с.-х. наук, доцент кафедры,
Леонова Мария Анатольевна,
кандидат с.-х. наук, ст. научный сотрудник,
Гетманцева Любовь Владимировна,
кандидат с.-х. наук, зав. лабораторией
ФГБОУ ВО Донской государственный аграрный университет, п. Персиановский,
Ростовская область, Россия
В статье представлены исследования влияния SNP генов PRLR, LEP, ESR, FSHb, MC4R, LIF, POU1F1, GH
на показатели воспроизводительных качеств свиней крупной белой породы. Анализ проведен с использованием
линейных моделей смешанного типа. Для каждого варианта SNP применялась отдельная модель, в качестве фик-
сированного фактора в которой выступал генотип по рассматриваемому гену. Другим фиксированным фактором
во всех моделях выступал порядковый номер опороса. Рандомизированным фактором являлись индивидуальные ге-
нотипы свиноматок. В результате анализа было установлено достоверное превосходство генотипа LEP/CC над
генотипом LEP/TT по всем показателям воспроизводительных качеств: по количеству поросят при рождении на
1,55 гол. (p = 0,02), по многоплодию на 1,8 гол. (p = 0,009), по массе гнезда при рождении на 1,91 кг (p = 0,05). По гену
ESR животные с генотипом ESR/ВВ также превосходили по всем рассматриваемым показателям своих анало-
гов с генотипом ESR/АА (по количеству поросят при рождении на 1,36 гол. (p = 0,14), по многоплодию на 0,93 гол.
(p = 0,005), по массе гнезда при рождении на 2,24 кг (p = 0,15)). По гену LIF в качестве наилучшего определен генотип
LIF/ВВ (количество поросят при рождении + 1,35 гол. (p = 0,15), многоплодие + 1,9 гол. (p = 0,04), масса гнезда при
рождении + 2,24 кг. (p = 0,24) относительно генотипа LIF/АА). Для гена PRLR установлено превосходство генотипа
PRLR/ВВ (количество поросят при рождении + 0,42 гол. (p = 0,4), многоплодие + 0,57 гол. (p = 0,25), масса гнезда при
рождении + 1,96 кг. (p = 0,01) относительно генотипа PRLR/АВ). Для остальных генов достоверных различий по вос-
производительным качествам между генотипами не установлено. С учетом полученных результатов разработана
панель генетических маркеров для оценки воспроизводительных качеств свиней крупной белой породы. Указанная
панель включает гены LEP, ESR , LIF , PRLR.
Ключевые слова:
SNP панель, свиньи, маркеры, PRLR, LEP, ESR, FSHb, MC4R, LIF, POU1F1, GH, линейные модели
Во многих странах для определения ге-
нетической ценности свиней активно исполь-
зуется технология SNP-чипов, позволяющая
идентифицировать большое количество нукле-
отидных замен (SNP). Однако высокая стои-
мость такого исследования может быть не всег-
да оправдана, особенно в условиях узко-спец-
ифических селекционных задач, т.к. бóльшая
часть идентифицируемых таким образом SNP
не является информативным относительно хо-
зяйственно ценных показателей. Кроме того,
ряд значимых SNP могут оказывать противопо-
ложное действие в условиях различных пород
и популяций, т.е. их влияние не носит универ-
сальный характер [1].
В связи с этим мы предлагаем использо-
вать в практической селекции ограниченный
набор высокоинформативных генетических
маркеров, ориентированных на достижение
конкретных целей селекции в отношении дан-
ной популяции животных, условно называемый
«панель ДНК-маркеров».
Цель
исследований
– разработать панель
генетических маркеров для оценки воспроизво-
дительных качеств свиней крупной белой породы
с применением смешанных линейных моделей.
Материал и методы.
Исследования
проводили на свиньях крупной белой породы
одного из ведущих племзаводов РФ. В выборку
были включены только свиноматки, имеющие
не менее трех опоросов. Анализ проводили по
первым трем опоросам. Воспроизводительные
качества оценивали по показателям: количе-
ство поросят при рождении (гол.); многоплодие
(гол.); масса гнезда при рождении (кг).
Анализ данных выполняли с использова-
нием собственного программного обеспечения
[2, 3, 4] и языка программирования для стати-
стической обработки данных R в среде R-stu-
dio. Методы анализа: смешанные линейные мо-
дели (Linear Mixed Effects Models). При исполь-
зовании линейных моделей смешанного типа
важную роль имеет выбор факторов, включен-
ных в состав модели. Проведенные ранее ис-
следования показали высокую достоверность
влияния порядкового номера опороса на ре-
продуктивные показатели свиноматок. В то же
время, факторы
стада-года-сезона
отела/опо-
Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека