NED373393NED

59 Болезни сельскохозяйственных животных Rus/Kemerovo/762-2/05 отсутствует. Такая конфигурация вставок привела к выделению трех категорий геномов ВНБ по их длине: 15186 нуклеоти- дов у «старых» генотипов класса II (I-IV), 15192 нуклеотидов у «новых» генотипов того же класса (V-VIII и IX) и 15198 нуклеотидов у штаммов и изолятов класса I. Однако совпадение известных вставок с точками дивергенции крупных филогенетических групп кажется удивительным и странным, поскольку никаких связанных с этими мутациями функциональных изменений в ге- номе выявлено не было, и изменения длины генома считаются не более чем нейтральными маркерными признаками филогенетических групп. В таком случае мутации типа вставок-делеций должны с некоторой, пусть низкой, частотой наблюдаться в геноме более мелких групп вирусов или одиноч- ных изолятов. Действительно, в последнее время такие данные появились. Так, в семи полных последовательностях геномов изолятов генотипа V от бакланов из Северной Америки (GQ88381-GQ88386, GQ88388) имеется вставка из 6 нуклеотидов в 3’НТО гена Р [7], а в опубликованной недавно последовательности изолята генотипа VII NDV/chicken/Togo/AKO18/2009 (JX390609) вставка 6 нуклеотидов имеется в межгенной области HN-L [6]. Суммарные данные по длине отдельных участков генома ВНБ и генома в целом представлены в табл. 2. Таблица 2 Длина структурных областей генома отдельных групп штаммов и изолятов ВНБ Область генома Длина (н.) для групп вирусов Локали- зация вставки класс I класс II «старые» генотипы класс II «новые» гено- типы изоляты от бакланов генотипа V NDV/ chicken/ Togo/ AKO18/09 Pi/Rus/ Kemerovo/ 762-2/05 Лидер 55 55 55 55 55 55 - Ген NP 1747 1747 1753 1753 1753 1753 NP 3’НТО NP-P МГО 1 1 1 1 1 1 - Ген P 1463* 1451 1451 1457** 1451 1451 *P ОРС, **P 3’НТО P-M МГО 1 1 1 1 1 1 - Ген M 1241 1241 1241 1241 1241 1241 - Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека