NED373393NED

57 Болезни сельскохозяйственных животных Референтный штамм (номер доступа GenBank) Гено- тип Нуклеотидные/аминокислотные отличия от Pi/Rus/ Kemerovo/762-2/05 по генам (%) NP P P/V* M F HN** L ZJ1 (DQ659677) VIId 10,3/ 5,2 13,6/ 17,0 14,5/ 23,1 10,6/ 5,3 11,0/ 6,0 11,0/ 7,6 9,7/ 4,6 chicken/N_Ireland/ Ulster/67 (AY562991) I 11,8/ 7,0 17,1/ 19,3 18,0/ 28,1 14,1/ 10,5 13,9 /9,1 13,2/ 8,6 12,4/ 5,7 LaSota (AF077761) II 15,1/ 8,8 18,3/ 21,1 18,4/ 29,3 15,7/ 11,9 15,6/ 10,9 16,0/ 10,0 13,8/ 6,9 DE-R49/99 (DQ097393) класс I 23,3/ 9,3 31,5/ 33,9 33,2/ 39,0 23,3/ 10,5 28,5/ 15,1 27,6/ 16,0 24,9/ 10,4 *- нуклеотиды 1-731 ОРС гена Р по длине рамки считывания последовательно- стей всех штаммов, кроме DE-R49/99 (DQ097393); **- нуклеотиды 1-1716 ОРС гена HN по самой короткой рамке считывания для 7 из 11 штаммов и изолятов, включая Pi/Rus/Kemerovo/762-2/05. Установлено, что изолят Pi/Rus/Kemerovo/762-2/05 содержит сайт про- теолитического расщепления, расположенный в позициях 112-117 амино- кислотной последовательности белка слияния F и соответствующий вари- анту с парными двухосновными аминокислотами ( 112 RRQKR-F 117 ), харак- терному для вирулентных штаммов ВНБ. Длина ОРС гена HN генома данного изолята соответствует длине белка в 571 а.о. и консервативна для генетических линий, включающих исключи- тельно вирулентные формы ВНБ (генотипы III-VIII). Матричные РНК, с которых транслируются белки V и W, транскриби- руются с гена Р со сдвигом рамки считывания в сайте редактирования на 1 и 2 остатка G, соответственно. Поэтому белки V и W обладают одинако- вым с белком Р N-концом и различными по длине и аминокислотной по- следовательности С-концами. Белок V имеет длину 239 или 245 а.о. [20]. У изолята Pi/Rus/Kemerovo/762-2/05 длина белка V составляет 239 а.о. Консервативной у изолята Pi/Rus/Kemerovo/762-2/05 является и длина белка W (227 а.о.), другого продукта трансляции гена Р, в отличие от ряда штаммов и изолятов генотипов I, II и V, у которых ОРС укорочена до 179 кодонов [17]. Возможно, наиболее интересной особенностью последовательности генома изолята Pi/Rus/Kemerovo/762-2/05 является наличие уникальной Продолж. табл. 1 Эл ктронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека