NED373390NED

Ящур и другие болезни крупного рогатого скота и свиней 61 третьей позиции триплета, являлась «молчащей» и не приводила к изменению аминокислотного остатка (а.о.). Изоляты № 2 и 3 отличались от 1-го и 4-го по одному н.о., причем замена была значимой и приводила к изменению а.о. в шестой позиции гликопротеина-5. Изолят № 5 отличался от остальных зна- чимой заменой в 103 позиции ORF5. Таким образом, уровень нуклеотидной гомологии ORF5 иркутских и китайских изолятов составлял 99,68-99,84%. Рис. 3. Дифференциация высокопатогенного штамма от «классических» штаммов вируса РРСС американского генотипа в ОТ-ПЦР по размеру ампликона 1 –штамм БД/Resp MLV («классический» штамм американского генотипа); 2 – иркутский изолят (высокопатогенный штамм); 3 – ДНК-маркер GeneRuller 100bp (Fermentas) Китайские исследователи, определившие полные последовательности генома нескольких десятков изолятов, выделенных во время эпизоотии, установили, что возможным маркером патогенности вируса – возбудителя атипичной формы РРСС является делеция 90 н.о. в ORF1b, кодирующей неструктурный протеин NSP2 (5, 6). Для того чтобы определить наличие маркерной делеции у иркутского изолята, мы разработали метод, позво- ляющий дифференцировать высокопатогенный штамм от «классических» штаммов вируса РРСС американского генотипа непосредственно в ПЦР Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека