NED373390NED

Ящур и другие болезни крупного рогатого скота и свиней 59 Рис. 1. Дендрограмма, отражающая положение изолята Иркутск/2007 на филогенетическом древе вируса РРСС американского генотипа. Основана на сравнении полных нуклеотидных последовательностей гена нуклеокапсидного белка (ORF7) ВШ – вакцинный штамм Важная диагностическая задача заключалась в определении проис- хождения выявленного вируса РРСС. В молекулярно-эпизоотологических исследованиях РРСС традиционно используют филогенетический анализ генов ORF7 и ORF5, кодирующих нуклеокапсидный белок и поверхност- ный гликопротеин-5, соответственно. Структура ORF7 отличается не- сколько большим консерватизмом по сравнению с ORF5, однако на осно- вании отличий именно в ORF7 различают несколько подтипов в преде- лах европейского генотипа вируса РРСС (1, 3). Поскольку исследования структуры генов нуклеокапсидного белка и поверхностного гликопротеи- на-5 дополняют друг друга, мы определили нуклеотидные последователь- ности как ORF7, так и ORF5 иркутских изолятов. Филогенетический анализ показал, что по структуре ORF7 вирусы, выявленные в трех пробах из с. Казарки и в двух пробах из МСП «Лена», идентичны между собой и имеют 100% гомологию с китайскими изоля- тами, выделенными в 2006-2007 гг. во время эпизоотии атипичного РРСС Электронная Нау ная СельскоХозяйственная Библиотека