NED373390NED

Ящур и другие болезни крупного рогатого скота и свиней 117 получены для гена VP7 штаммов, относящихся к одному G-серотипу (7). При строгом соблюдении терминологии, с помощью анализа ну- клеотидных последовательностей биологические объекты можно клас- сифицировать только на генотипы. Однако в данном случае было по- казано, что ротавирусы, относящиеся к одному и тому же генотипу, с другой стороны, относятся к одному и тому же серотипу. Поэтому мно- гие авторы на основании только молекулярно-биологических исследо- ваний делают вывод о серотипе ротавируса (8, 16, 27). Стоит заметить, что на основании анализа генома описано 15 G-генотипов и, как минимум, 20 Р-генотипов (17). То есть серологи- ческие исследования штаммов ротавирусов не успевают за молекулярно- биологическими. Помимо этого, анализ последовательностей штаммов разных G- и P-серотипов позволил выявить участки нуклеотидных последователь- ностей, характерные для вирусов каждого конкретного серотипа. Если к этим участкам подобрать соответствующие олигонуклеотиды, то с по- мощью полимеразной цепной реакции можно амплифицировать участки генов VP4 и VP7 (8, 11, 13, 15, 23). Поскольку расположение олигонуклео- тидов подбирается таким образом, что каждому исследуемому серотипу соответствует фрагмент кДНК определенной длины, то в одной реакции по длине фрагмента можно определять сразу несколько серотипов. Дополнительным преимуществом молекулярно-биологических мето- дов характеристики ротавирусов является то, что они позволяют опреде- лять серотипы ротавирусов очень быстро. Как правило, ротавирусы, поражающие животных определенного вида, относятся к ограниченному набору серотипов. Например, крупный рогатый скот чаще всего поражается ротавирусами G-серотипов 6, 8 и 10 и Р-серотипов 1, 5 и 11 (3, 9, 14, 28, 32); ротавирусы свиней чаще всего относятся к G-серотипам 4, 5 и 11 и Р-серотипам 6 и 7 (13) и т.д. Однако эти закономерности распределения серотипов ротавирусов по животным- хозяевам соблюдаются нестрого, возможно, из-за того, что эти вирусы сравнительно легко преодолевают межвидовые барьеры, и у различных животных часто выявляют ротавирусы «нетипичных» серотипов. Так, на- пример, в Германии от теленка был выделен штамм, характеризующийся G- и Р-серотипами, обычными для ротавирусов птиц (16). В ФГУ «ВНИИЗЖ» были разработаны методы определения G- и Р-серотипов ротавирусов крупного рогатого скота на основе нуклеотидного секвенирования и полимеразной цепной реакции. Нами было исследовано около 30 полевых изолятов ротавирусов крупного рогатого скота, выявлен- Электронная Научная СельскоХозяйственная Библиотека