NED365343NED

95 LD картирования является определение набора субпопуляций. Эффек- тивный метод, контролирующий структуру популяции при ассоциатив- ных тестах, использует матрицу генетической симилярности, устанав- ливаемую на основе данных, полученных с помощью молекулярных маркеров. Этот метод был с успехом применен на популяции кукурузы, содержащей три субпопуляции, уменьшающих число ложных позити- вов (Thornsberry et al., 2001). Величина и пределы LD зависит от многих факторов, включая историю популяции и частоту рекомбинации в экза- менуемом сегменте генома (Rafalski, 2002b). У растительных видов, где генетическое разнообразие популяции сокращается под действием эф- фекта селекционного отбора, таких как сахарный тростник или сахарная свекла, LD увеличивается на несколько сМ, как это было установлено с помощью RFLP и AFLP маркерных анализов (Jannoo et al., 1999; Kraft et al., 2000). Схожим образом, данные, полученные для сои, также имеющую очень узкую генетическую основу, показали, что LD ослабе- вает и может увеличиваться в пределах 2,0–2,5 сМ (Zhu et al., 2003). Ис- следования, проведенные на кукурузе, продемонстрировали, что LD ос- лабевает на расстоянии более 1500 пар оснований (п.о.), но дополни- тельные исследования позволили установить, что значения LD могут варьировать гораздо больше (Morgante, Salamini, 2003). На практике LD картирование с успехом было применено на модельном объекте араби- допсисе (Olsen et al., 2004), кукурузе (Thornsberry et al., 2001) и ряде других культур (см. Чесноков, 2013) для идентификации локусов хро- мосом, ассоциированных с изменчивостью признака времени цветения и не только. Методы ассоциаций, которые включают оценку структуры популяций, дают исследователям действенный подход для идентифика- ции аллелей, ответственных за изменчивость в изучаемом образце, ко- личественных признаков. Методология MAS хорошо зарекомендовала себя при линейной селекции и создании пирамид генов, а также при беккроссной селекции (Moose, Mumm, 2008). Линейная селекция на основе MAS с однократ- ным генотипированием (single large-scale marker-assisted selection — SLS-MAS) — метод селекции, отличающийся от традиционного метода линейной селекции (или метода педигри) тем, что в одном из ранних поколений с помощью маркеров проводится отбор растений для даль- нейшей селекции, что позволяет сразу исключить нежелательные гено- типы по некоторым признакам и тем самым существенно сократить объем последующих работ. Например, в случае одного основного гена, по которому ведется отбор, можно в поколении F 2 исключить из даль- нейшего анализа 75 % (3/4) нежелательных генотипов, в случае двух ге- нов — 94 % (15/16) нежелательных генотипов, в случае трех генов — 98 % (63/64). В отличие от линейной селекции на основе MAS с одно-