NED365343NED

85 5.1. Основные монолокусные и мультилокусные ДНК-маркеры, наиболее часто используемые при изучении генома растений (по Хлесткиной, 2011; с изменениями) Методы Маркеры монолокусные мультилокусные Основанные на блот- гибридизации RFLP (restriction fragment length polymorphism) — поли- морфизм длины рестрикцион- ных фрагментов (Botstein et al., 1980) Минисателлиты (Jeffreys et al ., 1985) Основанные на ПЦР SSR (simple sequences repeats) — простые повторяющиеся последовательности (микроса- теллиты) (Tautz, Renz, 1984) STS (sequences tagged site) — последовательности, характе- ризующие локус (Olson et al., 1989) SCAR (sequence characterized amplified region) — последова- тельность, характеризующая амплифицированную область (Paran, Michelmore, 1993) SSCP (single strand conformation polуmorphism) — полиморфизм конформации одноцепочечной ДНК (Orita et al., 1989) CAPS (cleaved amplified polymorphic sequences) — расщепленные амплифициро- ванные полиморфные после- довательности (Konieczny, Ausubel, 1993) RAPD (random amplified polymorphic DNA) — случайно амплифицированная поли- морфная ДНК (Williams et al., 1990; Welsh et al., 1992) ISSR (inter simple sequence repeats) — межмикросателлит- ные последовательности (Zietkiewicz et al., 1994) IRAP (inter-retrotransposon amplified polуmorphism) — по- лиморфизм амплифицирован- ных последовательностей ме- жду ретротранспозонами (Kalendar, Schulman, 2006) AFLP (amplified fragment length polymorphism) — поли- морфизм длины амплифици- рованных фрагментов (Vos et al., 1995) S-SAP (sequence-specific amplification polymorphism) — полиморфизм специфично ам- плифицированных последова- тельностей (Waugh et al., 1997) Основанные на применении сек- венирования и ДНК-чипов SNP (single nucleotide polymorphism) – однонуклеотидный полимор- физм (Wang et al., 1998) DArT (diversity array technology) — ДНК-чип тех- нология для изучения разно- образия (Jaccoud et al., 2001) − тесная ассоциация или сцепление между маркером и необходимым геном или QTL; − соответствующая рекомбинация между маркерами, ассоциированны- ми с интересующими селекционера признаками, и остальной частью генома; − возможности анализировать большое число особей за сравнительно небольшой промежуток времени и при относительно невысокой цене.