NED365343NED

72 отбора не влияют на нее. Поскольку при анализе также используется биаллельное кодирование, то во внимание должны приниматься неко- торые специфичные особенности генетической структуры изучаемого материала. Из-за этих недостатков статистика частоты аллелей обычно дополняется другим вычислением расчетов, что делает возможным рас- хождение с уравнением Харди-Вайнберга. Такие подходы зависят от методологии определения аллельных частот в экспериментальных дан- ных. Это может быть сделано посредством использования ряда различ- ных алгоритмов (см. Lynch, Milligan, 1994; Stewart, Excoffier, 1996; Zhivotovsky, 1999; Holsinger et al., 2002; Hill, Weir, 2004). Правильное определение частот существенно влияет на точность индексов, подсчи- танных для последующего установления количественной оценки гене- тического разнообразия. Кроме того, теоретические исследования (Nei, Roychoudhury, 1974) позволили установить, что для выявления генети- ческого разнообразия необходимость увеличения числа анализируемых локусов в геноме более важна, чем увеличение числа анализируемых особей. 4.4.1. Разнообразие аллелей ( А ) Самый простой способ измерить генетическое разнообразие — это определить количество присутствующих аллелей. Аллельное разно- образие ( А ) — это среднее число аллелей на локус и этот показатель до- вольно часто используют для описания генетического разнообразия. Ес- ли есть более чем один локус, А высчитывается как число аллелей, ус- редненное по всем локусам: A = n i / n l , где n i — общее число аллелей во всех локусах, а n l — число локусов. Наблюдаемое число аллелей ( n a ) может также быть найдено подсчетом числа аллелей на локус с после- дующим установлением среднего этих расчетов. Эти значения могут быть сравнены с эффективным числом аллелей ( n e ), которое есть число аллелей, необходимых для обеспечения такой гетерозиготности, при ко- торой все аллели присутствовали бы в равной пропорции. Этот показа- тель менее зависит от размера образца и редких аллелей и высчитывает- ся как n e = 1/∑ p i 2 , где p i — частота i -го аллеля. Таким образом, можно сказать, что этот показатель предоставляет информацию о способности к распространению организмов и степени изоляции среди популяций. 4.4.2. Эффективный размер популяции ( N e ) Концепция эффективного размера популяции ( N e ) играет важную роль в управлении сохранения генетических ресурсов растений (ГРР). Этот показатель позволяет измерить величину (частоту, уровень, долю) генетического дрейфа, уровень потери генетического разнообразия и увеличения близкородственного скрещивания внутри популяции. Со-

RkJQdWJsaXNoZXIy