NED365343NED

69 подразделах приводятся некоторые основные наиболее часто исполь- зуемые статистические подходы по оценке генетического разнообразия. 4.3.1. Подходы, основанные на прямой оценке профилей электрофо- ретических полос Самый легкий путь проанализировать профили электрофоретиче- ские полос и измерить разнообразие, представленное ими, — это обра- тить внимание на наличие тех или иных полос и сравнить образцы меж- ду собой по их присутствию или отсутствию. Этот метод повседневно используют на уровне оценки особей и, как правило, именно на основе анализа электрофоретических полос отдельных особей чаще всего вы- водят филогенетические дистанции, нежели принимая во внимание раз- нообразие всей популяции. Недостаток этого подхода заключается в том, что дело имеют скорее с данными полиморфизма продуцируемо- го молекулярными маркерами, нежели с описанием генетического раз- нообразия изучаемого организма. И хотя полученные результаты обыч- но коррелируют с генетическим разнообразием, установленные на их основе статистические коэффициенты часто не имеют биологического значения в популяционно-генетическом смысле. 4.3.2. Измерение полиморфизма Локус считается полиморфным, если полоса, определяющая по- лиморфизм, присутствует с частотой от 5 % до 95 %. Полиморфизм, представленный в профиле электрофоретических фрагментов, может быть получен простым визуальным выявлением и подсчетом общего числа полиморфных ампликонов и затем определением процента поли- морфных полос, присутствующих у каждой особи, основываясь на этом числе. Эта «информативность полос» ( I b ) может быть выражена в шкальной оценке, ранжированной от 0 до 1, и определенной в соот- ветствии с формулой: I b = 1 – (2 × |0,5 – p |), где p — количество геноти- пов, содержащих полосу. Для подсчета полиморфизма, получаемого с помощью RFLP-гибридизационных проб, используют эту же формулу. Однако, до того как гибридизационные пробы используют для выявле- ния полиморфизма у генотипов какой-либо популяции (образцы ГРР, селекционно-значимый материал и др.), такие пробы, как правило, предварительно проверяют на небольшой выборке особей изучаемой популяции (образца), при этом ДНК каждой особи должна быть перева- рена несколькими ферментами. В этом случае чаще всего выбраковы- вают пробы: (а) которые не гибридизуются с анализируемой ДНК (от- сутствует сигнал гибридизации), (б) которые дают слишком большие «шумы фона» или сложные профили (трудно различить и/или анализи- ровать получаемые результаты гибридизации) и (в) которые не выявля-