NED365343NED

68 из-за незнакомства с ними. Порой при проведении подобного рода ана- лизов возникают проблемы, причины которых трудно установить. Это прежде всего влияет на оценку получаемого электрофоретического профиля полос ДНК, напрямую зависящего от природы используемых методов и от того производят они доминантные или ко-доминантные маркеры. Ниже мы попытаемся дать краткое описание общих аналити- ческих подходов, которые могут быть применены для статистической оценки данных полиморфизма, продуцируемого современными молеку- лярно-генетическими методами. До тех пор пока последующие иссле- дования не выявят слабые места существующих ныне методов ДНК- фингерпринтинга, мы будем полагать, что эти недостатки не являются серьезной причиной отклонения получаемого набора данных. Наши описания основываются на оригинальных работах обсуждаемых подхо- дов и детально рассматриваются в исходных статьях, которые мы цити- руем, или на наших собственных работах по применению некоторых молекулярно-генетических методов исследования (Артемьева и др., 2008а,б; Вишнякова и др., 2008; Иванов и др., 2012; Чесноков, 2013 и др.). Можно выделить две особенности генетических маркеров, ис- пользуемых для ДНК-фингерпринтинга, которые в значительной степе- ни определяют то, как они могут быть статистически проанализированы. Во-первых, полиморфные локусы, получаемые такими маркерами, обычно обсчитываются по двум аллелям: аллель «присутствующей по- лосы» и аллель «отсутствующей полосы». Это делает каждый локус ме- нее информативным, чем мультиаллельный (например, микросателлит- ный) локус. Однако большое число маркеров, разбросанных по всему геному, или специфичное исследование множественных районов и их распределение может нейтрализовать действие этой отрицательной сто- роны ДНК-маркерной системы. Во-вторых, получаемые для каждого подхода электрофоретические профили полос, обычно, в процессе оценки обрабатываются как доминантные маркеры, но методы их оцен- ки соответствующим образом описываются отдельно. И хотя трудно различить гетерозиготные особи от гомозиготных посредством аллелей «присутствующих полос», тем не менее, генотипы могут быть установ- лены, исходя из исследования их родословной (van Haeringen et al., 2002). Однако это положение может измениться в будущем, а методы необходимым образом преобразованы, если техническая природа каж- дой маркерной системы должным образом будет оценена и раскрыта. На сегодняшний день сравнительно небольшое число маркеров ДНК- фингерпринтинга могут быть признаны ко-доминантными, или давать смешанные профили доминантных и ко-доминантных маркеров (Karp et al., 1997; Weising et al., 2005; Spooner et al., 2005). В нижеследующих