NED365343NED

53 Рис. 3.7. Принцип SSR анализа. Стрелками обозначены прямой и обратный праймеры, фланкирующие последова- тельности условно обозначены короткими прямыми линиями. Поскольку SSR, как правило, очень многочисленны, очевидно, что блот-гибридизация по Саузерну не может быть эффективной для опре- деления их профилей. В то же время, ПЦР позволяет выявлять их инди- видуально, продуцируя кодоминантные и высоко полиморфные локус- специфичные маркеры. Даже если данные SSR не являются специфич- ными непосредственно для изучаемого локуса, они наверняка находятся в прилежащем к этому локусу районе. Пара праймеров, специфичная для таких прилежащих районов, позволяет амплифицировать нужный SSR, формируя маркер неравновесного сцепления, что может иметь су- щественное значение при скрининге ГРР, исходного селекционно- значимого материала и при проведении молекулярно-генетического картирования. SSR представляют собой отличные генетические марке- ры со всеми преимуществами ПЦР анализа и зачастую используются в повседневной лабораторной практике. Множественные SSR являются яркой иллюстрацией таких преимуществ. Так, например, SSR адаптиро- ваны для картирования у кукурузы (Senior, Heun, 1993), риса (Wu, Tanksley, 1993), ячменя (Sagai-Maroof et al., 1994), сои (Morgante et al., 1994), арабидопсиса (Bell, Ecker, 1994) и ряде других культур, а также для анализа и скрининга биоразнообразия у винограда (Thomas et al., 1994), риса (Yang et al., 1994) и сои (Powell et al., 1996). Ранее их приме- нение в популяционной генетике также было достаточно наглядно про- демонстрировано (Jarne, Lagoda, 1996). Помимо SSR могут быть амплифицированы и множественные ISSR (Inter-SSR) локусы. Для этого создают праймер, который состоит частично из SSR последовательности, а частично из произвольных ос-