NED365343NED

42 3.2. Процент уникальных локусов, выявленных в соответствии с происхождением пробы Виды гнДНК- Eco RI гнДНК- Pst I кДНК Томат 33 92 95 Рис 50 58 85 Чечевица 38 41 88 Саузерну комплекс множественных полос (или зон) на радиоавтографе. В то время как при проведении обыкновенного RFLP анализа исполь- зуют, как правило, локус-специфичные пробы, позволяющие получать сравнительно легко скринируемые кодоминантные маркеры или зоны; и 2) ДНК-фингерпринтинг в основном проводится с неспецифичными для какого-либо биологического вида пробами, которые гомологичны, распределенным по геному последовательностям, таким, например, как микросателлиты, в то время как пробы, использующиеся при проведе- нии обычного RFLP анализа, как правило, видоспецифичны. Таким об- разом, для того, чтобы получить типичный ДНК-фингерпринт, исполь- зуют пробу, которая гомологична множественным геномным локусам ДНК. Каждый из этих локусов обычно характеризуется более или менее регулярно устроенными тандемно расположенными ДНК мотивами, распределенными по геному в различном числе и порядке. Для проведения ДНК-фингерпринтинг анализа обычно использу- ют две категории мультилокусных проб. Первая категория включает в себя в качестве проб клонированные фрагменты ДНК или олигонук- леотиды, которые комплементарны так называемым «минисателлитам» (Jeffreys et al., 1985), то есть тандемным повторам с основным (или ко- ровым) мотивом от 10 до 60 пар нуклеотидов (п.н.). Вторая категория представлена олигонуклеотидными пробами, которые комплементарны, так называемым «простым последовательностям» (Tautz, Renz, 1984) или «микросателлитам» (Litt, Luty, 1989), то есть тандемным повторам с очень короткими мотивами, в основном от 1 до 5 п.н. 3.4. Мини- и микросателлиты Повторяющиеся последовательности ДНК являются неотъемле- мой частью эукариотических геномов и могут составлять до 90 % общей ДНК некоторых растительных геномов. Согласно характеру их органи- зации, повторяющиеся последовательности ДНК могут быть классифи- цированы либо как распределенные по геному, либо как тандемно орга- низованные. В первом случае, повторяющиеся в ДНК мотивы обнару- живаются во множестве сайтов, которые практически равномерно рас- пределены по всему геному. Во втором случае, тандемные повторы со- держат от двух до нескольких тысяч ключевых или коровых мотивов,