NED365343NED

21 праймера длиной в 20 произвольно выбранных нуклеотидных осно- ваний и имеющего низкую температуру отжига; − SCAR — Sequence-Characterization Amplified Region — ПЦР ампли- фикация фрагментов геномной ДНК с помощью специфичных прай- меров (14–20 нуклеотидов). Эти праймеры определяются из последо- вательности определенных RAPD-амплифицированных фрагментов ДНК, которые после разделения их электрофорезом в геле, клониру- ются и секвенируются; − STS — Sequence Tagged Site — ПЦР амплификация последовательно- сти ДНК со специфичными праймерами. Можно использовать и другие методические подходы, которые дают не столь высокоточный результат при идентификации различных последовательностей ДНК, но также позволяют выявлять генетический полиморфизм на уровне нуклеотидных последовательностей генотипов. Это такие методы как: − RAPD — Random Amplification Polymorphic DNA — ПЦР амплифи- кация ДНК-фрагментов при помощи праймеров, содержащих в своем составе от 10 и более случайных нуклеотидов; − AFLP — Amplified Fragment Length Polymorphism — ПЦР амплифи- кация геномной ДНК, предварительно разрезанной двумя специфич- ными рестрикционными эндонуклеазами и имеющей на концах спе- циальные адапторы длинной около 20 пар нуклеотидных оснований (п. о.). Праймеры для AFLP анализа имеют ту же последовательность, что и адапторы плюс 2–3 случайных п. о., добавленных к 3'-концу; − ISSR — Inter Simple Sequence Repeats — ПЦР амплификация геном- ной ДНК, расположенной между микросателлитными локусами, с помощью праймеров, которые несут динуклеотидные повторы и в некоторых позициях случайные нуклеотидные основания. Фактически речь идет о MAAP — Multiple Arbitrary Amplicon Pro- filing — общем термине, обозначающем все методы ПЦР амплификации геномной ДНК (RAPD, RAMPO, AP-PCR, DAF, AFLP, ISSR и другие), при проведении которых, как правило, используют случайные прайме- ры и образуются комплексные полиморфные электрофоретические профили. Получение такой информации и/или продукции в виде клони- рованных и идентифицированных последовательностей ДНК позволит перейти на качественно иной уровень изучения организации и функ- ционирования геномов растений, их физиологических, биохимических и молекулярно-генетических взаимодействий, как внутри геномов, так и с лимитирующими факторами внешней среды (табл. 2.1).